24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3399 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3399  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.274598  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0940  hypothetical protein  56.9 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3949  hypothetical protein  49.24 
 
 		 325 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.315669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1336  hypothetical protein  47.28 
 
 		 362 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3710  hypothetical protein  46.84 
 
 		 323 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.483452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1765  hypothetical protein  50.39 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6682  hypothetical protein  37.89 
 
 		 567 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0015  hypothetical protein  34.96 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2933  hypothetical protein  30.94 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0010  hypothetical protein  40.26 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0777049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3351  hypothetical protein  34.05 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0663  hypothetical protein  34.94 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0016  hypothetical protein  31.77 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.571689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0018  hypothetical protein  30.77 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0017  hypothetical protein  29.69 
 
 		 278 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1125  hypothetical protein  29.34 
 
 		 283 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.730205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6501  hypothetical protein  43.37 
 
 		 208 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0254  hypothetical protein  41.67 
 
 		 190 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0348  hypothetical protein  40.35 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  51.04 
 
 		 1261 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0316  conserved hypothetical conserved membrane protein  38.6 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0732  hypothetical protein  37.04 
 
 		 161 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.38 
 
 		 453 aa  43.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0653  hypothetical protein  39.66 
 
 		 188 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.344221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>