More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3366 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3697  TonB-dependent receptor  48.44 
 
 		 731 aa  646    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0941  TonB-dependent receptor  80.39 
 
 		 716 aa  1165    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3366  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 708 aa  1450    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5501  TonB-dependent receptor  48.44 
 
 		 731 aa  647    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2482  TonB-dependent receptor  45.64 
 
 		 728 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1983  TonB-dependent receptor  44.21 
 
 		 727 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.454223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2970  TonB-dependent receptor  45.59 
 
 		 718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222916  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1191  TonB-dependent receptor  46.33 
 
 		 744 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.601925 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  42.14 
 
 		 697 aa  549  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  37.57 
 
 		 654 aa  437  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  36.64 
 
 		 674 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1472  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 683 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.907424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  37.37 
 
 		 685 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  37.08 
 
 		 675 aa  429  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 657 aa  413  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  36.49 
 
 		 675 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  35.47 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  35.66 
 
 		 667 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0604  TonB-dependent outer membrane receptor  32.52 
 
 		 682 aa  339  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 693 aa  337  5.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 663 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 656 aa  300  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 656 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1516  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 690 aa  226  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.18651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  26.39 
 
 		 653 aa  169  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 678 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 665 aa  159  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 669 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 699 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  22.97 
 
 		 663 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  22.75 
 
 		 663 aa  98.6  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  23.23 
 
 		 677 aa  97.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  22.96 
 
 		 666 aa  95.5  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  22.07 
 
 		 666 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.21 
 
 		 666 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  22.07 
 
 		 666 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 650 aa  90.9  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 649 aa  90.5  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  21.92 
 
 		 666 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05316  putative ferrisiderophore receptor protein  27.35 
 
 		 779 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 682 aa  89.4  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  21.65 
 
 		 613 aa  88.2  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 709 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  22.42 
 
 		 638 aa  85.5  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 634 aa  85.5  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 651 aa  84  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  21.91 
 
 		 653 aa  84  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  21.72 
 
 		 634 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4136  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163344  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4248  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 772 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 715 aa  80.9  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  22.83 
 
 		 641 aa  80.5  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.26 
 
 		 639 aa  79.7  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  21.56 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 656 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 679 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.36 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 698 aa  75.1  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 688 aa  74.7  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1237  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 736 aa  74.3  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  21.1 
 
 		 845 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 836 aa  73.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.74 
 
 		 807 aa  72  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  26.07 
 
 		 662 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3675  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0831004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 635 aa  70.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 668 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  26.07 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 741 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2744  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 686 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.339912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 670 aa  68.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 828 aa  68.9  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  27.31 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.59 
 
 		 775 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 815 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.29 
 
 		 631 aa  68.2  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.75 
 
 		 655 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 653 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 673 aa  66.6  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4029  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 719 aa  66.6  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 692 aa  66.2  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 749 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  22.22 
 
 		 665 aa  65.9  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 737 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 702 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.56 
 
 		 616 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000158  TonB-dependent heme and hemoglobin receptor HutA  22.24 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00497898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 767 aa  64.7  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  21.35 
 
 		 661 aa  64.3  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 690 aa  64.3  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 695 aa  64.3  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1260  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  22.11 
 
 		 698 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>