More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3292 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  55.89 
 
 		 724 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  55.67 
 
 		 705 aa  740    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 771 aa  1573    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  52.89 
 
 		 719 aa  726    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  56.12 
 
 		 724 aa  745    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  49.2 
 
 		 755 aa  625  1e-178  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  48.69 
 
 		 756 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  47.38 
 
 		 755 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  43.4 
 
 		 727 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  39.29 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  39.48 
 
 		 735 aa  444  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 693 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 770 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 710 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  32.85 
 
 		 710 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  34.46 
 
 		 792 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 		 709 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 757 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 707 aa  320  7e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 719 aa  317  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 694 aa  295  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 706 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  31.95 
 
 		 706 aa  293  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  32.02 
 
 		 715 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 821 aa  291  4e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 		 745 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  30.82 
 
 		 695 aa  273  6e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.58 
 
 		 726 aa  265  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 726 aa  262  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  28.71 
 
 		 734 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 732 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 860 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  28.33 
 
 		 680 aa  249  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.83 
 
 		 732 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 817 aa  245  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 742 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 		 742 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 		 712 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 700 aa  244  6e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0894  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 747 aa  242  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.744699  normal  0.840328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  29.14 
 
 		 749 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  29.43 
 
 		 708 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  29.12 
 
 		 656 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  28.96 
 
 		 736 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 769 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1607  TonB-dependent siderophore receptor  29.78 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0198  outer membrane ferric siderophore receptor  29.78 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0160883  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  28.55 
 
 		 740 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  29.06 
 
 		 741 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1688  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 748 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 733 aa  236  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 689 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0794  TonB-dependent siderophore receptor  28.95 
 
 		 749 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.038915  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  29.69 
 
 		 741 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 689 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4712  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 747 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.779821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  28.06 
 
 		 751 aa  234  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1203  outer membrane ferric siderophore receptor  28.87 
 
 		 772 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.83325  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4190  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 747 aa  233  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 850 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5475  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 747 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.546607  normal  0.0926979 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4808  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 747 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.981163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 698 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 734 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 732 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 731 aa  230  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3559  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 747 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 722 aa  229  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 		 710 aa  229  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  27.33 
 
 		 753 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3969  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 793 aa  228  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1948  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 815 aa  227  7e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3795  TonB-dependent siderophore receptor  29.02 
 
 		 748 aa  227  7e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506743 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 733 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 730 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  29.71 
 
 		 763 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3335  TonB-dependent receptor, plug  26.76 
 
 		 794 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 760 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 780 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00772  predicted iron outer membrane transporter  27.57 
 
 		 760 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00789  hypothetical protein  27.57 
 
 		 760 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0101  TonB-dependent siderophore receptor  27.44 
 
 		 759 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0829  catecholate siderophore receptor Fiu  27.57 
 
 		 760 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 726 aa  219  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 815 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 753 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0873  catecholate siderophore receptor Fiu  27.29 
 
 		 760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  26.76 
 
 		 712 aa  218  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2837  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  28.43 
 
 		 709 aa  218  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0108  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 759 aa  218  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0860  catecholate siderophore receptor Fiu  27.29 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0954  catecholate siderophore receptor Fiu  27.29 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.691601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2838  catecholate siderophore receptor Fiu  27.29 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.167931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  28.09 
 
 		 712 aa  217  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2088  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 793 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0823412 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  27 
 
 		 837 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>