More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3287 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  45.15 
 
 		 1142 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  46.8 
 
 		 1148 aa  697    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  49.81 
 
 		 803 aa  748    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  44.43 
 
 		 765 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 781 aa  1620    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  47.39 
 
 		 1138 aa  673    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  45.04 
 
 		 1155 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  49.81 
 
 		 803 aa  751    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  45.93 
 
 		 820 aa  673    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  49.87 
 
 		 807 aa  747    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0507  molydopterin dinucleotide-binding region  27.77 
 
 		 952 aa  266  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.485596  normal  0.607063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.68 
 
 		 789 aa  250  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  28.78 
 
 		 817 aa  243  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 		 778 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0515  molydopterin dinucleotide-binding region  27.07 
 
 		 964 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.470196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 		 817 aa  226  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.49 
 
 		 826 aa  221  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 856 aa  221  6e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 800 aa  211  4e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 		 876 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  25.4 
 
 		 898 aa  210  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4231  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 		 818 aa  208  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.75 
 
 		 857 aa  208  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 777 aa  207  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 		 812 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  25.25 
 
 		 821 aa  205  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  32.48 
 
 		 1135 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 805 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.53 
 
 		 953 aa  197  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.66 
 
 		 698 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  32.9 
 
 		 700 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 		 805 aa  196  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  29.9 
 
 		 685 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.29 
 
 		 942 aa  195  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  23.58 
 
 		 971 aa  194  4e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.89 
 
 		 824 aa  194  6e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3264  Nitrate reductase  24.77 
 
 		 836 aa  194  7e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0520925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  26.01 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 		 694 aa  193  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.33 
 
 		 739 aa  193  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 		 839 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 		 729 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.78 
 
 		 969 aa  191  5e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.71 
 
 		 698 aa  191  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 		 784 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 698 aa  190  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  31.58 
 
 		 711 aa  190  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.56 
 
 		 910 aa  190  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  26.43 
 
 		 703 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.11 
 
 		 698 aa  187  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 		 794 aa  187  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1597  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 		 800 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0501  molydopterin dinucleotide-binding region  23.44 
 
 		 1032 aa  186  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.638156 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.65 
 
 		 1023 aa  184  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  31.05 
 
 		 1143 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07940  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.39 
 
 		 834 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000379038 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.51 
 
 		 806 aa  182  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1011  molybdopterin oxidoreductase  25.91 
 
 		 787 aa  181  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0550449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  24.16 
 
 		 851 aa  181  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.8 
 
 		 864 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  29.82 
 
 		 1139 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  26.31 
 
 		 691 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13690  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25.44 
 
 		 871 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.88 
 
 		 836 aa  174  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 		 1055 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 		 747 aa  174  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2584  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  24.16 
 
 		 927 aa  173  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.822778  normal  0.769168 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  32.69 
 
 		 1027 aa  173  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27 
 
 		 692 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3051  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 		 822 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27670  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  25 
 
 		 813 aa  170  1e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22740  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.81 
 
 		 1053 aa  168  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.945653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 		 734 aa  167  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 745 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 978 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  21.97 
 
 		 669 aa  165  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  36.12 
 
 		 891 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.56 
 
 		 978 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.88 
 
 		 978 aa  164  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.88 
 
 		 973 aa  164  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 973 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.88 
 
 		 973 aa  164  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.56 
 
 		 973 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.72 
 
 		 973 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.37 
 
 		 799 aa  161  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 858 aa  160  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.33 
 
 		 820 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 		 761 aa  158  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  26.1 
 
 		 749 aa  157  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 701 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  23.4 
 
 		 961 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  24.8 
 
 		 668 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.7 
 
 		 847 aa  155  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  23.53 
 
 		 978 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27730  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.62 
 
 		 801 aa  155  4e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.953321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  28.37 
 
 		 911 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.52 
 
 		 981 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.68 
 
 		 794 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0497  molydopterin dinucleotide-binding region  27.52 
 
 		 1102 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.455569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 1130 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>