292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3272 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
235 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  82.98 
 
 
251 aa  379  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  61.64 
 
 
429 aa  275  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  60.87 
 
 
242 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  63.23 
 
 
248 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  63 
 
 
246 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  60.09 
 
 
248 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  54.24 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  55 
 
 
243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  55.2 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  50.68 
 
 
243 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  50.68 
 
 
243 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  51.5 
 
 
239 aa  198  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  47.79 
 
 
241 aa  193  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  49.28 
 
 
240 aa  175  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  42.62 
 
 
245 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  42.44 
 
 
245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  40.95 
 
 
238 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  40.19 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  36.78 
 
 
240 aa  137  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  35.12 
 
 
236 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  39.66 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  39.81 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  37.71 
 
 
252 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  36.89 
 
 
241 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  41.23 
 
 
242 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  39.91 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  38.46 
 
 
241 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
239 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  36.4 
 
 
240 aa  129  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  35.32 
 
 
235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  37.85 
 
 
265 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  44.19 
 
 
243 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  38.75 
 
 
261 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  41.94 
 
 
245 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  41.94 
 
 
245 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  41.94 
 
 
245 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  36.21 
 
 
373 aa  122  6e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  37.96 
 
 
494 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  44.19 
 
 
243 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  42.08 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  40.85 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.47 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  37.86 
 
 
262 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  34.3 
 
 
238 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  34.76 
 
 
265 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  38.53 
 
 
249 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  35.83 
 
 
241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  33.46 
 
 
274 aa  118  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  37.75 
 
 
236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  37.74 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  41.05 
 
 
243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  35.92 
 
 
260 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  36.25 
 
 
248 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  37.26 
 
 
245 aa  115  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.57 
 
 
244 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  34.6 
 
 
237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  33.02 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  36.07 
 
 
271 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  46.28 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  33.64 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
245 aa  112  5e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  35.06 
 
 
246 aa  112  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  31.46 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  41.99 
 
 
447 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
245 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  36.71 
 
 
246 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  34.26 
 
 
272 aa  107  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  35.68 
 
 
250 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  37.2 
 
 
248 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  34.24 
 
 
279 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  28.77 
 
 
220 aa  106  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  35.98 
 
 
256 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  32.33 
 
 
277 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  35.47 
 
 
249 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  30.49 
 
 
240 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  32.83 
 
 
220 aa  104  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  31.58 
 
 
303 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  35.53 
 
 
248 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  33.66 
 
 
238 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  34.58 
 
 
257 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
240 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
258 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  37.04 
 
 
265 aa  103  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.62 
 
 
241 aa  103  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  30.25 
 
 
272 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  35.51 
 
 
238 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  42.11 
 
 
233 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  38.56 
 
 
254 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.08 
 
 
280 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  34.72 
 
 
248 aa  102  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  40.11 
 
 
244 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1793  6-phosphogluconolactonase  34.5 
 
 
261 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  32.67 
 
 
272 aa  99  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  36.28 
 
 
257 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  36.84 
 
 
235 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>