21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3268 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3268  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2640  hypothetical protein  90.59 
 
 		 85 aa  159  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794076 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3667  hypothetical protein  68.24 
 
 		 85 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4150  hypothetical protein  63.53 
 
 		 85 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.819687  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1895  hypothetical protein  61.18 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3472  hypothetical protein  60 
 
 		 85 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.951183  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6299  hypothetical protein  58.82 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4563  hypothetical protein  55.29 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271369  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0671  hypothetical protein  56.47 
 
 		 85 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0882  hypothetical protein  63.51 
 
 		 89 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0921  hypothetical protein  63.51 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0857  hypothetical protein  57.14 
 
 		 89 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.945495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3052  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0400386  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0304  hypothetical protein  36 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2301  hypothetical protein  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.662209  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0062  hypothetical protein  41.38 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3387  hypothetical protein  39.08 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3859  hypothetical protein  38.1 
 
 		 82 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.150331 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4442  hypothetical protein  33.77 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0785  hypothetical protein  37.8 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.325049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0076  hypothetical protein  33.75 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>