286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3218 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0719  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.4 
 
 
557 aa  744    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136312  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2473  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.91 
 
 
551 aa  643    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.163  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2658  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  69.34 
 
 
568 aa  793    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0620  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.92 
 
 
563 aa  786    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6299  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.93 
 
 
549 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0621  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.92 
 
 
563 aa  786    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.994915  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4767  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.7 
 
 
557 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3075  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  58.79 
 
 
549 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.816418  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2595  FAD dependent oxidoreductase  90.05 
 
 
553 aa  1032    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.399286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0942  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  71.84 
 
 
554 aa  836    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589953  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1777  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase precursor  58.18 
 
 
551 aa  661    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.964971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5421  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  64.2 
 
 
554 aa  709    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428869  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1084  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.32 
 
 
552 aa  855    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.29604  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1781  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.12 
 
 
549 aa  645    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.420074  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0484  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58.72 
 
 
548 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4617  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.52 
 
 
557 aa  700    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288677  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1392  electrotransfer ubiquinone oxidoreductase  70.71 
 
 
553 aa  810    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6076  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  65.1 
 
 
554 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4358  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  76.49 
 
 
552 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0903296  normal  0.0136742 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0649  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.22 
 
 
554 aa  782    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0725  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  59.02 
 
 
549 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2167  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.47 
 
 
557 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.068758  normal  0.0582717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2346  putative electron transfer flavoprotein dehydrogenase  83.73 
 
 
552 aa  962    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398943  normal  0.0520477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1211  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  74.86 
 
 
552 aa  862    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3218  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  100 
 
 
580 aa  1199    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4075  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.13 
 
 
557 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.556531  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3268  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  61.74 
 
 
563 aa  706    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.545567  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3745  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  60.55 
 
 
549 aa  694    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1229  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  77.22 
 
 
552 aa  883    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0911  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  68.32 
 
 
568 aa  788    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2188  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.62 
 
 
557 aa  743    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0425  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.43 
 
 
548 aa  649    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4247  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  63.7 
 
 
557 aa  702    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05315  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1091  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.58 
 
 
554 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.358633 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0444  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  66.61 
 
 
557 aa  759    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1039  electron transfer flavoprotein-ubiquinone dehydrogenase  59.86 
 
 
553 aa  723    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0424  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  58 
 
 
551 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349819  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2374  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  70.07 
 
 
557 aa  820    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.694979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1262  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.83 
 
 
562 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.12476  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1185  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.89 
 
 
551 aa  630  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.068389  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0265  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  57.53 
 
 
545 aa  625  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0224484  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0282  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.09 
 
 
555 aa  625  1e-178  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00443387  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1950  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.28 
 
 
568 aa  622  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1936  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.54 
 
 
548 aa  618  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000473381  normal  0.135998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1146  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.68 
 
 
561 aa  621  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0276165  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0942  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.367234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1715  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
581 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1116  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, putative  55.14 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000360257  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1869  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0418968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1691  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
581 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2613  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.32 
 
 
557 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1999  S6 modification enzyme RimK  56.31 
 
 
545 aa  616  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.329248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1567  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.86 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1750  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.59 
 
 
533 aa  617  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.109424 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1558  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000216807  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0219  putative electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.14 
 
 
557 aa  618  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0824  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.69 
 
 
556 aa  613  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0158  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.19 
 
 
558 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4827  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.82 
 
 
555 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1472  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.52 
 
 
550 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00301285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1788  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.04 
 
 
557 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236528  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1439  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.5 
 
 
557 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1015  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.79 
 
 
556 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.103701  normal  0.772735 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5364  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.26 
 
 
557 aa  609  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.798054  normal  0.228806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0979  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.5 
 
 
557 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.438928  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1554  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 
557 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935108  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5772  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.08 
 
 
557 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.412443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1461  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.5 
 
 
557 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6275  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 
557 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0634592  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15160  electron-transferring-flavoprotein ubiquinone oxido-reductase  58.15 
 
 
550 aa  609  1e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561576  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6767  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 
557 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6919  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.9 
 
 
556 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2069  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.6 
 
 
561 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388318 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4606  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.5 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.142327  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1386  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.68 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5532  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.08 
 
 
557 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1988  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.43 
 
 
545 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4203  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.03 
 
 
560 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1567  electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54.35 
 
 
562 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1994  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.06 
 
 
551 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6873  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.72 
 
 
557 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100379  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1751  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.28 
 
 
568 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1986  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.8 
 
 
561 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1346  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.32 
 
 
557 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1650  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.03 
 
 
560 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3775  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.29 
 
 
554 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2765  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.54 
 
 
557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126018  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0158  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.39 
 
 
569 aa  598  1e-170  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0228  FAD dependent oxidoreductase:electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  54 
 
 
547 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0378  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.32 
 
 
563 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1656  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.8 
 
 
561 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.125425  normal  0.0341229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1362  electron transferring flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase  55.35 
 
 
557 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.61271  normal  0.825058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4310  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  54.46 
 
 
566 aa  594  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.744462  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4100  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  56.91 
 
 
549 aa  594  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1239  hypothetical protein  53.99 
 
 
543 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1239  hypothetical protein  53.8 
 
 
543 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1895  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  52.94 
 
 
591 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.895715 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3289  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.32 
 
 
567 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3981  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  53.39 
 
 
566 aa  592  1e-168  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0944928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3527  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  55.76 
 
 
554 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>