42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3105 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3105  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  371  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2513  hypothetical protein  86.75 
 
 		 166 aa  304  5.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.31273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3881  hypothetical protein  77.65 
 
 		 179 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.832488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1407  hypothetical protein  84.34 
 
 		 166 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.246502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4848  Protein of unknown function DUF1790  80.12 
 
 		 166 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1744  hypothetical protein  78.31 
 
 		 166 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4170  hypothetical protein  77.11 
 
 		 166 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4947  hypothetical protein  52.53 
 
 		 169 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.399738  hitchhiker  0.000000153474 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2546  hypothetical protein  56.02 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2250  hypothetical protein  52.41 
 
 		 166 aa  195  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1475  hypothetical protein  49.45 
 
 		 243 aa  195  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3019  Protein of unknown function DUF1790  50 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2756  Protein of unknown function DUF1790  50 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1525  hypothetical protein  49.45 
 
 		 220 aa  194  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1137  Protein of unknown function DUF1790  50.6 
 
 		 166 aa  194  6e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00643359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2148  hypothetical protein  50.6 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.8454  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1641  hypothetical protein  51.2 
 
 		 166 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0854  hypothetical protein  49.69 
 
 		 167 aa  191  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1376  Protein of unknown function DUF1790  49.69 
 
 		 167 aa  190  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2264  hypothetical protein  51.27 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3169  hypothetical protein  49.4 
 
 		 166 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3770  hypothetical protein  48.19 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.465916  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4064  Protein of unknown function DUF1790  48.19 
 
 		 168 aa  187  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4025  Protein of unknown function DUF1790  46.99 
 
 		 168 aa  186  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.377233  normal  0.351333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1259  hypothetical protein  50.6 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00906465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3280  hypothetical protein  45.62 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0991  hypothetical protein  43.98 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0359037  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2703  hypothetical protein  43.03 
 
 		 167 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.600419  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1096  Protein of unknown function DUF1790  44.52 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.820328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0763  hypothetical protein  43.87 
 
 		 167 aa  144  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.396097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1141  hypothetical protein  37.91 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0676  hypothetical protein  37.01 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.298237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0622  hypothetical protein  35.54 
 
 		 166 aa  131  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4471  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.39855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0039  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.158376  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2646  hypothetical protein  35.47 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.364701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1322  hypothetical protein  34.13 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.19423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2199  hypothetical protein  33.73 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00724399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3363  hypothetical protein  34.5 
 
 		 173 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3330  hypothetical protein  33.12 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.635014  normal  0.855915 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3008  hypothetical protein  34.13 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.719619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1940  hypothetical protein  27.62 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.473224  normal  0.0765452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>