More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3095 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  86.25 
 
 
291 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.35 
 
 
286 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.18 
 
 
284 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.36 
 
 
288 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  74.73 
 
 
287 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  76.01 
 
 
285 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.36 
 
 
272 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.59 
 
 
296 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.94 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.62 
 
 
275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.77 
 
 
300 aa  292  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.48 
 
 
272 aa  291  7e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.85 
 
 
282 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
296 aa  288  8e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.71 
 
 
276 aa  285  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.92 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.7 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.48 
 
 
287 aa  278  5e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.74 
 
 
274 aa  278  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.05 
 
 
281 aa  270  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.44 
 
 
281 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.55 
 
 
280 aa  267  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.44 
 
 
281 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.03 
 
 
282 aa  265  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.44 
 
 
300 aa  259  4e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.09 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.09 
 
 
266 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.91 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
257 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.67 
 
 
302 aa  242  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.74 
 
 
257 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
296 aa  240  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.19 
 
 
261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.04 
 
 
292 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.75 
 
 
270 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
279 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.75 
 
 
270 aa  235  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
265 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
263 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.31 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.49 
 
 
260 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.31 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.77 
 
 
290 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
292 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
273 aa  229  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.35 
 
 
292 aa  229  5e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.27 
 
 
262 aa  229  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.31 
 
 
269 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.83 
 
 
291 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.51 
 
 
256 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.51 
 
 
256 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.79 
 
 
271 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.01 
 
 
287 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
268 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.15 
 
 
273 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.91 
 
 
275 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
271 aa  223  3e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.46 
 
 
296 aa  223  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.03 
 
 
280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.07 
 
 
267 aa  221  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
276 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.72 
 
 
267 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.16 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.82 
 
 
261 aa  219  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 
285 aa  219  5e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
265 aa  218  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.32 
 
 
264 aa  218  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.82 
 
 
289 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.61 
 
 
266 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.69 
 
 
261 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
266 aa  217  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
263 aa  217  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.78 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.23 
 
 
296 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.23 
 
 
296 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.59 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.6 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.56 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.19 
 
 
296 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.81 
 
 
268 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.36 
 
 
260 aa  216  5e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.41 
 
 
303 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
268 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
268 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.61 
 
 
269 aa  214  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.73 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.93 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.61 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.56 
 
 
298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.56 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.56 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>