184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2994 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_6074  potassium-transporting ATPase subunit A  59.4 
 
 
569 aa  670    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0209  potassium-transporting ATPase subunit A  74.6 
 
 
571 aa  872    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202017  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1155  potassium-transporting ATPase subunit A  63.35 
 
 
569 aa  694    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4645  potassium-transporting ATPase subunit A  80.95 
 
 
567 aa  932    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4550  potassium-transporting ATPase subunit A  80.07 
 
 
567 aa  921    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.439804  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0193  potassium-transporting ATPase subunit A  75.84 
 
 
571 aa  859    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.699521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0662  potassium-transporting ATPase subunit A  76.58 
 
 
567 aa  858    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2994  potassium-transporting ATPase subunit A  100 
 
 
567 aa  1122    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0954  potassium-transporting ATPase subunit A  77.07 
 
 
571 aa  876    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5835  potassium-transporting ATPase subunit A  71.25 
 
 
567 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.069816  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6747  potassium-transporting ATPase subunit A  70.55 
 
 
567 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6338  potassium-transporting ATPase subunit A  81.83 
 
 
567 aa  951    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0224535 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1468  potassium-transporting ATPase, A subunit  64.2 
 
 
567 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.084132  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5358  potassium-transporting ATPase subunit A  61.23 
 
 
569 aa  635    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.267227  normal  0.0726113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2826  potassium-transporting ATPase, A subunit  69.14 
 
 
569 aa  778    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3776  potassium-transporting ATPase subunit A  70.37 
 
 
567 aa  800    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3413  potassium-transporting ATPase subunit A  80.07 
 
 
567 aa  925    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3240  potassium-transporting ATPase subunit A  79.54 
 
 
571 aa  900    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.47874  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0177  potassium-transporting ATPase subunit A  72.84 
 
 
571 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133184  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0233  potassium-transporting ATPase subunit A  72.66 
 
 
571 aa  801    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.41425  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3382  potassium-transporting ATPase subunit A  56.34 
 
 
590 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2091  potassium-transporting ATPase, A subunit  57.47 
 
 
572 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3589  potassium-transporting ATPase subunit A  56.68 
 
 
590 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0122147  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1087  potassium-transporting ATPase subunit A  55.24 
 
 
592 aa  610  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.43397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3267  potassium-transporting ATPase subunit A  56.16 
 
 
590 aa  611  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.749431  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0874  potassium-transporting ATPase, A subunit  59.27 
 
 
572 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.481077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0038  potassium-transporting ATPase subunit A  54.76 
 
 
610 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2275  potassium-transporting ATPase subunit A  55.34 
 
 
579 aa  604  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2507  K+ transporting ATPase A chain  58.06 
 
 
576 aa  601  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.750399  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0510  potassium-transporting ATPase subunit A  54.48 
 
 
591 aa  597  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328065  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1670  potassium-transporting ATPase subunit A  53.97 
 
 
596 aa  598  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.646576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4995  potassium-transporting ATPase subunit A  59.25 
 
 
575 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1159  potassium-transporting ATPase subunit A  56.79 
 
 
562 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  56.38 
 
 
559 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.515707  hitchhiker  0.00491151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1227  potassium-transporting ATPase subunit A  52.54 
 
 
592 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1871  potassium-transporting ATPase, A subunit  55.73 
 
 
582 aa  588  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1108  potassium-transporting ATPase subunit A  56.79 
 
 
562 aa  590  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3582  potassium-transporting ATPase subunit A  56.79 
 
 
562 aa  589  1e-167  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2293  potassium-transporting ATPase subunit A  54.95 
 
 
605 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2217  potassium-transporting ATPase subunit A  54.56 
 
 
595 aa  580  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.631048  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0864  potassium-transporting ATPase subunit A  57.72 
 
 
559 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.823568 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0814  potassium-transporting ATPase subunit A  57.92 
 
 
559 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0828  potassium-transporting ATPase subunit A  57.72 
 
 
559 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068706 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0754  potassium-transporting ATPase subunit A  57.92 
 
 
559 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380625  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3604  potassium-transporting ATPase subunit A  54.7 
 
 
599 aa  579  1e-164  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.894614 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1479  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.72 
 
 
568 aa  581  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00655  potassium-transporting ATPase subunit A  54.72 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2938  potassium-transporting ATPase, A subunit  54.72 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2242  potassium-transporting ATPase, A subunit  53.69 
 
 
564 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00752993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2608  potassium-transporting ATPase subunit A  51.93 
 
 
594 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00646  hypothetical protein  54.72 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0767  potassium-transporting ATPase subunit A  57.53 
 
 
559 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2958  potassium-transporting ATPase subunit A  54.72 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0745  potassium-transporting ATPase subunit A  54.72 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0724  potassium-transporting ATPase subunit A  54.37 
 
 
557 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1248  potassium-transporting ATPase subunit A  57.7 
 
 
562 aa  573  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.353689  normal  0.87869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0551  potassium-transporting ATPase subunit A  54.19 
 
 
557 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2047  potassium-transporting ATPase subunit A  53.32 
 
 
564 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.931973  normal  0.439277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0355  potassium-transporting ATPase subunit A  54.73 
 
 
601 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0720  potassium-transporting ATPase subunit A  54.01 
 
 
557 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.621163  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2204  potassium-transporting ATPase subunit A  53.28 
 
 
601 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.891481 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11047  potassium-transporting ATPase subunit A  51.14 
 
 
571 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0791  potassium-transporting ATPase subunit A  56.87 
 
 
557 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2326  potassium-transporting ATPase subunit A  53.11 
 
 
601 aa  568  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1130  potassium-transporting ATPase subunit A  54 
 
 
561 aa  567  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.227065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2480  potassium-transporting ATPase subunit A  52.92 
 
 
592 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2433  potassium-transporting ATPase subunit A  52.73 
 
 
586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000446057  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2311  potassium-transporting ATPase subunit A  52.61 
 
 
601 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1676  potassium-transporting ATPase subunit A  52.44 
 
 
601 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43400  potassium-transporting ATPase subunit A  55.05 
 
 
564 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24054  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2288  potassium-transporting ATPase subunit A  52.44 
 
 
601 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3640  potassium-transporting ATPase subunit A  55.42 
 
 
564 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0990  potassium-transporting ATPase subunit A  52.94 
 
 
601 aa  560  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3230  potassium-transporting ATPase subunit A  52.82 
 
 
574 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5615  potassium-transporting ATPase subunit A  52.45 
 
 
601 aa  557  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0268524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3733  potassium-transporting ATPase subunit A  54.27 
 
 
564 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1210  potassium-transporting ATPase subunit A  52.71 
 
 
578 aa  556  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.110111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0722  potassium-transporting ATPase, A subunit  52.27 
 
 
576 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0894  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.94 
 
 
811 aa  555  1e-156  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00635984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1707  potassium-transporting ATPase subunit A  53.74 
 
 
564 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.260767  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4161  potassium-transporting ATPase subunit A  53.2 
 
 
564 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.222505  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1265  potassium-transporting ATPase subunit A  57.53 
 
 
551 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0053  potassium-transporting ATPase subunit A  52.82 
 
 
569 aa  548  1e-154  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.350618  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2923  potassium-transporting ATPase subunit A  57.34 
 
 
551 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.519235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3486  potassium-transporting ATPase subunit A  53.74 
 
 
564 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4242  potassium-transporting ATPase subunit A  53.11 
 
 
569 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1021  potassium-transporting ATPase subunit A  52.13 
 
 
602 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69964  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1218  potassium-transporting ATPase subunit A  54.89 
 
 
562 aa  536  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.924812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1096  potassium-transporting ATPase subunit A  52.68 
 
 
568 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0443  potassium-transporting ATPase, A subunit  50.52 
 
 
584 aa  530  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.393361  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2383  potassium-transporting ATPase subunit A  51.94 
 
 
567 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.959423  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4033  potassium-transporting ATPase subunit A  52.89 
 
 
564 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.845156  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2057  potassium-transporting ATPase subunit A  52.02 
 
 
601 aa  522  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0612031  normal  0.429028 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1876  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.797416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1393  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1083  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.742854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0784  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1241  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.863816  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1249  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0366  potassium-transporting ATPase subunit A  52.46 
 
 
602 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>