186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2952 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2952  ModE family transcriptional regulator  100 
 
 		 118 aa  236  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 141 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  54.37 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  54.37 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  46.15 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 116 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  45.19 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  48.15 
 
 		 177 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  50.55 
 
 		 107 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  45.92 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 129 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  45.92 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  46.23 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1950  ModE family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 137 aa  94.4  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0318025  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  47.78 
 
 		 125 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  49.54 
 
 		 125 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  45.37 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3480  transcriptional regulator ModE  52.25 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1193  ModE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.239879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  41.76 
 
 		 114 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  57.47 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  50 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3855  ModE family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 117 aa  80.1  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.81779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  45.36 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  41.76 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  45.05 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  45 
 
 		 262 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  45 
 
 		 262 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  40 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  49.33 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  46.25 
 
 		 272 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  39.08 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  30.93 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  35.87 
 
 		 263 aa  67.8  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  46 
 
 		 270 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  46 
 
 		 270 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1578  putative transcriptional regulator, ModE family  34.91 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.82567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 108 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.29 
 
 		 263 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  29.73 
 
 		 245 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  52.63 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1131  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  46.75 
 
 		 257 aa  61.6  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  38.1 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  45.12 
 
 		 268 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  37.21 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  37.35 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  34.94 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  35.06 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  42.68 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  40.7 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 261 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  45.95 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  52.83 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0938  putative transcriptional regulator, ModE family  37.5 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  40.26 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  43.9 
 
 		 270 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  45.45 
 
 		 269 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  43.75 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  43.75 
 
 		 254 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 266 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  40.74 
 
 		 267 aa  57  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0386  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.129709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0360  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0390  ModE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.920005  normal  0.212591 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.68 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2075  molybdenum transport regulator  37.14 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>