108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2887 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2887  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2460  hypothetical protein  88.41 
 
 		 70 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.373756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0965  hypothetical protein  63.77 
 
 		 70 aa  90.5  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2071  hypothetical protein  60 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416333  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2249  hypothetical protein  63.24 
 
 		 72 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1790  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  86.7  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0307  hypothetical protein  67.14 
 
 		 69 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1818  hypothetical protein  56.52 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.545831  normal  0.101728 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1296  hypothetical protein  61.54 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00174423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10384  protein transport protein secE2  58.46 
 
 		 71 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.96604e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1265  hypothetical protein  47.83 
 
 		 70 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1516  hypothetical protein  46.38 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1707  hypothetical protein  42.03 
 
 		 70 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3395  protein of unknown function DUF1458  47.14 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.42441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0202  protein of unknown function DUF1458  42.86 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0546  hypothetical protein  40.58 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2274  protein of unknown function DUF1458  41.43 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000000872393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2454  protein of unknown function DUF1458  43.48 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.803426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3058  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  57  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2417  hypothetical protein  40.58 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0138053 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1147  hypothetical protein  38.57 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0963984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3625  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1287  hypothetical protein  41.43 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.925487  normal  0.643908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3026  protein of unknown function DUF1458  42.86 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0262302 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5942  hypothetical protein  41.43 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0881826  hitchhiker  0.00766382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2570  hypothetical protein  37.14 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1944  hypothetical protein  38.57 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307456  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0118  hypothetical protein  31.43 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.813718  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1232  protein of unknown function DUF1458  36.36 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000336605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2575  protein of unknown function DUF1458  37.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0020  protein of unknown function DUF1458  42.42 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0718  hypothetical protein  44.12 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.287234  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3459  TRIM7; tripartite subunit-containing 7  43.94 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2871  hypothetical protein  37.68 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2917  protein of unknown function DUF1458  34.78 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2616  protein of unknown function DUF1458  28.99 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2524  hypothetical protein  39.44 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1966  hypothetical protein  40.3 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.653562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1315  hypothetical protein  34.67 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.76957  hitchhiker  0.00854236 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0035  protein of unknown function DUF1458  35.38 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0025  hypothetical protein  34.78 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00461369  normal  0.188661 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2873  hypothetical protein  38.03 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.272861  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2377  hypothetical protein  39.44 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.836659  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2419  hypothetical protein  39.44 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11529  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.18165 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3527  hypothetical protein  40 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2075  hypothetical protein  38.03 
 
 		 105 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381889  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1416  protein of unknown function DUF1458  32.86 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.065081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2636  protein of unknown function DUF1458  39.13 
 
 		 69 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5579  hypothetical protein  29.85 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1660  protein of unknown function DUF1458  38.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.717949  normal  0.348077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1441  hypothetical protein  43.94 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.857436  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5265  hypothetical protein  34.29 
 
 		 69 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.604284  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0195  hypothetical protein  42.65 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1941  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.453713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1868  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0927  hypothetical protein  41.54 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4069  hypothetical protein  38.57 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1978  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0375499 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4204  protein of unknown function DUF1458  37.68 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0494  protein of unknown function DUF1458  32.86 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0732836 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4314  protein of unknown function DUF1458  37.68 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.302415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3381  protein of unknown function DUF1458  34.78 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000254634  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6124  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1954  hypothetical protein  32.86 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1305  hypothetical protein  36.23 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.268431  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2992  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.100946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2504  protein of unknown function DUF1458  32.86 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0772  protein of unknown function DUF1458  32.86 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0177  hypothetical protein  38.24 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0882703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2067  protein of unknown function DUF1458  32.79 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000129244  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0896  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3012  hypothetical protein  36.36 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2317  protein of unknown function DUF1458  34.78 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1942  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00110853  normal  0.953866 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1727  protein of unknown function DUF1458  40.91 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0054  protein of unknown function DUF1458  30.77 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2825  hypothetical protein  31.88 
 
 		 68 aa  44.3  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1894  hypothetical protein  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.200081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0075  hypothetical protein  38.1 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1985  protein of unknown function DUF1458  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00566832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2070  protein of unknown function DUF1458  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02080  hypothetical protein  39.44 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.155855  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1866  protein of unknown function DUF1458  41.18 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1669  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0040  hypothetical protein  38.46 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.224078  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3647  hypothetical protein  29.85 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.654472 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1437  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.71589  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1223  hypothetical protein  36.67 
 
 		 64 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000254328  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1249  protein of unknown function DUF1458  33.33 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0086  hypothetical protein  36.62 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00140145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0829  hypothetical protein  35.38 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0101  hypothetical protein  36.62 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3195  hypothetical protein  36.92 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07040  hypothetical protein  31.34 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2850  protein of unknown function DUF1458  31.88 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2453  protein of unknown function DUF1458  40.3 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.149343 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2980  hypothetical protein  35.94 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>