More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2882 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2882  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 
226 aa  457  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2455  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  95.58 
 
 
226 aa  441  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4611  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  82.74 
 
 
224 aa  387  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1451  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 
226 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.861297 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1510  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  82.3 
 
 
226 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3840  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  79.65 
 
 
226 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6807  ATPase, ParA type  80.09 
 
 
225 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.739325 
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5757  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.9 
 
 
215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3460  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3124  cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.75 
 
 
216 aa  160  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0597611 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3356  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.41 
 
 
211 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0032  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.44 
 
 
234 aa  118  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.146181  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1906  plasmid partitioning-family protein  36.27 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3065  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.65 
 
 
241 aa  115  7.999999999999999e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0077  hypothetical protein  36.59 
 
 
267 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.228977 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0078  hypothetical protein  35.07 
 
 
249 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.291271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2166  chromosome partitioning ATPase protein-like protein  31.8 
 
 
309 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.443224  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0625  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.13 
 
 
232 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0681  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
215 aa  102  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1504  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.99 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0239725  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6984  hypothetical protein  32.52 
 
 
223 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2220  ParA family partition protein  32.37 
 
 
250 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112998  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6363  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.86 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3515  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.93 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.858877  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3697  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.86 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.321056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3388  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.33 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.395731  normal  0.623749 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.3 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277645  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.48 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1482  ParA family protein  32.18 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.184868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.29 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1481  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.29 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.06 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6419  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.997176 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.73 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2788  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2641  partition protein A  34.44 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5120  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.39 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.92 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0014  ParaA family ATPase  29.63 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.308628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.66 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4996  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.82 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2216  hypothetical protein  30.69 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  28.43 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.28 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.69 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.72 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.5 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.88 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.66 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
217 aa  72  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.29 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0041  chromosome segregation ATPase  26.45 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.95 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1153  putative partition-related protein  36.42 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.72 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.24 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2729  partition-related protein  35 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.578011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.52 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.06 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2777  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.78 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.84936 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0129  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.62 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.24 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4482  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.67 
 
 
240 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.41765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1675  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  35.62 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2068  putative partition-related protein  29.05 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.15 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2485  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.75 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.833437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  30.19 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3304  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.77 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.740315  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.51 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5598  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.96 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000000765743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.58 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0805  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.1 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.50757e-20  unclonable  0.0000000618537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  29.72 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.04 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.19 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.25 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  28.51 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.52 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2637  ParA-like protein  31.07 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.367255  normal  0.182137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3490  ParA family ATPase  36.89 
 
 
212 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2127  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  24.46 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  24.32 
 
 
260 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  30.19 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>