221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2864 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2864  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 443 aa  866    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3228  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 427 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 432 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  38.59 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  38.59 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 412 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  37.1 
 
 		 436 aa  259  6e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2658  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 433 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  38.9 
 
 		 417 aa  236  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0619  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.425561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0618  major facilitator family transporter  35.52 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  36.1 
 
 		 411 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  34.72 
 
 		 428 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 412 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 447 aa  225  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  37.62 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  36.64 
 
 		 427 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 409 aa  219  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0801  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 411 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.419426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 418 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0751  major facilitator transporter  36.87 
 
 		 481 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0105844  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3933  hypothetical protein  36.24 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  33 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  33.16 
 
 		 410 aa  214  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 421 aa  211  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  36.78 
 
 		 404 aa  210  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0699  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 474 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000337729  hitchhiker  0.00021718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  31.79 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0685  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000174953  hitchhiker  0.000330115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  35.6 
 
 		 471 aa  206  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3922  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 480 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 		 480 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3262  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000595189  hitchhiker  0.0000189305 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0929  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 430 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  32.46 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 480 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  33.42 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0513  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 459 aa  200  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1821  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 444 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000983336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0226  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.200681  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  34.21 
 
 		 411 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34670  Transmembrane transport protein  37.09 
 
 		 429 aa  195  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 408 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 452 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0091  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 471 aa  192  7e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 443 aa  189  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2491  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  32.39 
 
 		 465 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2043  major facilitator family transporter  28.17 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2783  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2175  normal  0.236028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0112  major facilitator superfamily transporter  34.38 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01548  transmembrane transport protein  38.73 
 
 		 412 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  33.41 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3082  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 454 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  32.41 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2641  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  31.8 
 
 		 438 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  33.03 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 713 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  29.25 
 
 		 726 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0467  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 439 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.677382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2384  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0101  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2857  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 436 aa  169  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0668265  normal  0.278101 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 446 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 464 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5368  major facilitator family transporter  32.35 
 
 		 385 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 421 aa  136  8e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  27.51 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  27.22 
 
 		 395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0576  major facilitator superfamily transporter  25.27 
 
 		 398 aa  133  6e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0999  major facilitator family protein  27.11 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.329257  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  27.78 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1328  hypothetical protein  27.33 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0020  putative MFS family transporter protein  30.23 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1991  putative MFS family transporter protein  27.57 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2348  putative MFS family transporter protein  29.88 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2247  putative MFS family transporter protein  27.67 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  26.04 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>