299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2815 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 212 aa  421  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  80.38 
 
 		 213 aa  349  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  71.77 
 
 		 212 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  73.58 
 
 		 213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  59.9 
 
 		 212 aa  263  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  63.77 
 
 		 209 aa  261  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  71.51 
 
 		 212 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  57.97 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  57.97 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  60.98 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  61.54 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  62.32 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  62.44 
 
 		 213 aa  234  9e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  59.02 
 
 		 202 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  62.56 
 
 		 202 aa  226  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  46.73 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  37.56 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  40.84 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  38.22 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  38.22 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  44.95 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  44.95 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  43.48 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  41.09 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  47.5 
 
 		 210 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  38.97 
 
 		 242 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  43.15 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  40.57 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  45.88 
 
 		 210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  43.07 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  44.85 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  43.16 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  45.95 
 
 		 474 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  41.36 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  41.21 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  41.4 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  40.64 
 
 		 217 aa  125  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 201 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  33.91 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  33.33 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  30.7 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  35.18 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  40.37 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  31.3 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  38.17 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.86 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.53 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2663  dethiobiotin synthase  39.77 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.265102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  35.62 
 
 		 234 aa  95.1  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  32.39 
 
 		 242 aa  94  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  31.61 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.99 
 
 		 242 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  30.57 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  36.52 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  33.85 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  26.82 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  37.02 
 
 		 266 aa  92.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  35.45 
 
 		 263 aa  91.7  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.46 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  36.63 
 
 		 241 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  42.26 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  39.08 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  37.13 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  30.77 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  37.04 
 
 		 646 aa  89.7  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  40.8 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  35.15 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.85 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  30.29 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  30.29 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  30.29 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2946  dethiobiotin synthase  33.65 
 
 		 239 aa  88.2  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00040484  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  30.29 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  31.98 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  37.13 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2243  dethiobiotin synthase  31.8 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.519579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  35.35 
 
 		 244 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0082  dithiobiotin synthetase  36.72 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  40.57 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  31.98 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  35.65 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4330  dithiobiotin synthetase  32.58 
 
 		 228 aa  85.1  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.112465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 254 aa  84.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.9 
 
 		 249 aa  84.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  32.88 
 
 		 228 aa  84.7  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  34.47 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  35.58 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  29.49 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>