More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2804 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  89.47 
 
 		 415 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  100 
 
 		 399 aa  815    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5728  serine-glyoxylate aminotransferase  75.19 
 
 		 395 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  63.73 
 
 		 401 aa  525  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  65.36 
 
 		 400 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  64.27 
 
 		 402 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  63.99 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  61.71 
 
 		 398 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  63.47 
 
 		 391 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  62.3 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  59.22 
 
 		 401 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  62.95 
 
 		 391 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  60.42 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  60.78 
 
 		 406 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  59.6 
 
 		 406 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  60.1 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  60.26 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  57.83 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2753  aminotransferase, class V  59.53 
 
 		 406 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  57.25 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  58.07 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  56.41 
 
 		 414 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  54.71 
 
 		 398 aa  451  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  54.34 
 
 		 413 aa  450  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3486  Serine--glyoxylate transaminase  57.11 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415302  normal  0.243284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2767  aminotransferase class V  57.36 
 
 		 397 aa  430  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4373  Serine--glyoxylate transaminase  56.93 
 
 		 397 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.150786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4911  aminotransferase class V  56.85 
 
 		 397 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  48.48 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  49.47 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  49.47 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1369  Serine--glyoxylate transaminase  48.06 
 
 		 397 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  48.42 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  49.23 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  45.59 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  44.59 
 
 		 396 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  46.94 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  46.94 
 
 		 402 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  46.68 
 
 		 402 aa  347  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  44.3 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  44.03 
 
 		 391 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1406  serine--glyoxylate aminotransferase  47.62 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  44.09 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  44.92 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  45.21 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  42.44 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6210  Serine--glyoxylate transaminase  43.47 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164021 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  41.75 
 
 		 396 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  43.55 
 
 		 383 aa  297  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0780  Serine--glyoxylate transaminase  38.82 
 
 		 395 aa  292  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  44.42 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  44.42 
 
 		 382 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4629  Serine--glyoxylate transaminase  40.1 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0544  putative aminotransferase, class V  39.9 
 
 		 395 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0857  aminotransferase class V  39.85 
 
 		 395 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  42.45 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  41.84 
 
 		 385 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  39.22 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  39.95 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  39.22 
 
 		 384 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  41.15 
 
 		 382 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  44.17 
 
 		 382 aa  269  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  40.11 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  39.14 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  38.87 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  40.63 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  40 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4689  aminotransferase, class V  37.76 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  42.2 
 
 		 386 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  40.56 
 
 		 382 aa  258  9e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  43.33 
 
 		 397 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  42.41 
 
 		 382 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  38.08 
 
 		 385 aa  256  6e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  37.53 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  37.8 
 
 		 387 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  38.79 
 
 		 383 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  37.27 
 
 		 384 aa  253  6e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.05 
 
 		 400 aa  248  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1983  aminotransferase, class V  38.81 
 
 		 404 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.441158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  41.67 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  38.68 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  37.11 
 
 		 380 aa  243  5e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  36.48 
 
 		 380 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  37.27 
 
 		 379 aa  237  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  35.73 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  35.86 
 
 		 379 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.71 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  36.39 
 
 		 381 aa  233  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  38.26 
 
 		 383 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  35.43 
 
 		 382 aa  233  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.59 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  36.39 
 
 		 379 aa  231  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.15 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3472  aminotransferase, class V  35.37 
 
 		 396 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  34.9 
 
 		 386 aa  229  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 380 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  34.05 
 
 		 379 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 382 aa  220  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  33.68 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  33.86 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>