More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2764 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
390 aa  811    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  37.09 
 
 
434 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
431 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  36.81 
 
 
417 aa  176  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  36.24 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 
366 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 
435 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 
374 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
420 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 
371 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  30.03 
 
 
380 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
380 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.9 
 
 
370 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
385 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  34.72 
 
 
384 aa  156  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
371 aa  155  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
377 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  33.79 
 
 
386 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
381 aa  155  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  35.38 
 
 
366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  33.81 
 
 
397 aa  154  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 
395 aa  153  5e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  32.63 
 
 
387 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
381 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 
370 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  27.75 
 
 
381 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  33.56 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.77 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  33.44 
 
 
382 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
398 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.38 
 
 
370 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
381 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
444 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
400 aa  143  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0742  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
367 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
382 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
360 aa  135  9e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  28.32 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
378 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 
380 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  32.11 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  27.36 
 
 
384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2280  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
367 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00320483  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  31.76 
 
 
367 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.23 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  27.48 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  30.37 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
428 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  29.66 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  31.94 
 
 
535 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  27.61 
 
 
376 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  30.42 
 
 
524 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 
375 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  28.39 
 
 
374 aa  126  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
373 aa  126  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
372 aa  126  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.48 
 
 
346 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
354 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
384 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
346 aa  125  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 
423 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
366 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
371 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 
394 aa  124  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
368 aa  123  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  29.45 
 
 
369 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
370 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.29 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
372 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
380 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
340 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
393 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
376 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 
381 aa  117  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  27.7 
 
 
373 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.03 
 
 
377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
381 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
375 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.52 
 
 
375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  33.07 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1333  glycosyl transferase, group 1 family protein, putative  31 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  25.97 
 
 
381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  31.15 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  28.45 
 
 
374 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3951  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 
408 aa  112  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.703007 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
1229 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.04 
 
 
366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0744  glycosyl transferase group 1  30.69 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.299994  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.21 
 
 
373 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>