263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2724 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 241 aa  481  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  91.25 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  79.75 
 
 		 296 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  78.57 
 
 		 297 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  76.47 
 
 		 297 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  77.64 
 
 		 297 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  75.89 
 
 		 226 aa  342  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  66.67 
 
 		 299 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  65.55 
 
 		 298 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  66.67 
 
 		 299 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  64.35 
 
 		 296 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  68.51 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  64.04 
 
 		 296 aa  295  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  62.71 
 
 		 295 aa  292  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  63.56 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  62.18 
 
 		 296 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  62.61 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  60 
 
 		 295 aa  284  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  63.29 
 
 		 298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  62.76 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  66.81 
 
 		 298 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  58.9 
 
 		 296 aa  273  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  62.72 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  65.27 
 
 		 297 aa  270  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  60.53 
 
 		 291 aa  270  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  62.29 
 
 		 325 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  60.53 
 
 		 291 aa  265  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  57.87 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  60.62 
 
 		 291 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  59.73 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  59.65 
 
 		 291 aa  258  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  57.98 
 
 		 309 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  60.79 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  54.39 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  54.66 
 
 		 299 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  52.77 
 
 		 332 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  55.07 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  49.37 
 
 		 298 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  50 
 
 		 294 aa  188  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  46.26 
 
 		 297 aa  182  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  43.84 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  41.33 
 
 		 278 aa  168  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  44.4 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.54 
 
 		 281 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  46.73 
 
 		 322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  42.42 
 
 		 410 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  45.09 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  45.09 
 
 		 372 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  40.61 
 
 		 275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 400 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  43.11 
 
 		 420 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  44.95 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.08 
 
 		 400 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  45.23 
 
 		 279 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  45.1 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  47.78 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  46.05 
 
 		 429 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 418 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  44.78 
 
 		 418 aa  161  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  46.02 
 
 		 404 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 415 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  45.23 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  43.29 
 
 		 432 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.37 
 
 		 404 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.58 
 
 		 404 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  45.32 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 		 398 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  42.54 
 
 		 296 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  44.22 
 
 		 279 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.58 
 
 		 404 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  44.83 
 
 		 316 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  44.83 
 
 		 316 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  42.86 
 
 		 403 aa  158  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  44.83 
 
 		 281 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.37 
 
 		 404 aa  158  7e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  45.21 
 
 		 236 aa  158  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44.55 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  43.53 
 
 		 419 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  42.37 
 
 		 404 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  43.84 
 
 		 316 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  43.46 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  43.84 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1419  phosphoserine phosphatase SerB  48.13 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  44.33 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  43.81 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  42.92 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  42.86 
 
 		 454 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  43.72 
 
 		 406 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  43.53 
 
 		 429 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  46 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  43.53 
 
 		 404 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.22 
 
 		 285 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  43.22 
 
 		 281 aa  155  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>