More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2570 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2570  cytochrome B561  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.95 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.39 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  36.52 
 
 		 183 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  36.52 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  37.08 
 
 		 183 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  34.46 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  32.11 
 
 		 186 aa  97.8  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  34.59 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  31.46 
 
 		 186 aa  96.3  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  35.39 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.05 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2889  cytochrome B561  33.69 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0592122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  35 
 
 		 192 aa  94.7  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  32.97 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  35.8 
 
 		 196 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  32.79 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  29.48 
 
 		 182 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.36 
 
 		 416 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  31.87 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  33.72 
 
 		 178 aa  92.8  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  30.06 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  33.15 
 
 		 184 aa  91.7  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  33.16 
 
 		 183 aa  91.3  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  33.33 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  33.33 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  32.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  32.98 
 
 		 188 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  33.33 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  32.12 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  34.44 
 
 		 176 aa  89.4  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  31.82 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  33.33 
 
 		 186 aa  89  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  33.33 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  32.12 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  32.12 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  32 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  32.12 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  31.94 
 
 		 397 aa  86.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5285  cytochrome B561  34.78 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621373  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  34.46 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  34.62 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  32.73 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1216  cytochrome b561  31.35 
 
 		 183 aa  85.9  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000559854  normal  0.299312 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  31.9 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  31.52 
 
 		 186 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  29.41 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1888  cytochrome B561  32.02 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.743741  hitchhiker  0.000498058 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  30.91 
 
 		 186 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  34.31 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  31.84 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.15 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1120  cytochrome B561  31.72 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000137011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2129  cytochrome B561  35.14 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000482046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1610  cytochrome B561  31.46 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.726643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  30.73 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  31.18 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  30.46 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3871  putative cytochrome b561  34.63 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2876  cytochrome B561  34.22 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.379711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  28.41 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  32.12 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.25 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  31.1 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3371  cytochrome B561  33.7 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  31.87 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  31.76 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1820  cytochrome b561 family protein  30.39 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0593327  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1930  cytochrome B561  30.39 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  31.72 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0472  putative cytochrome b561  31.72 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  2.73245e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  30.23 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2223  cytochrome b561 family protein  29.44 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0039455  hitchhiker  0.00454282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  29.35 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0932  cytochrome b561 family protein  33.33 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  31.52 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  30.91 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2152  cytochrome B561  32.47 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00081786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0456  cytochrome B561  34.24 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  31.58 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1316  cytochrome B561  31.15 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171547  normal  0.725201 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2215  hypothetical protein  30.73 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.511005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  29.63 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  31.58 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  31.33 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  26.86 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  31.58 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  32.6 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.71 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>