More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2459 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1419  major facilitator transporter  91.91 
 
 
418 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.532316  normal  0.700077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2459  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  67.17 
 
 
421 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  67.17 
 
 
421 aa  511  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  61.35 
 
 
435 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  59.21 
 
 
418 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  60.55 
 
 
435 aa  500  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  66.92 
 
 
422 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  66.08 
 
 
424 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  60.34 
 
 
420 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  60.45 
 
 
436 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  62.41 
 
 
428 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  60.7 
 
 
417 aa  492  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1540  major facilitator family transporter  65.59 
 
 
424 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  65.59 
 
 
424 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  60.7 
 
 
440 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  66.09 
 
 
428 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  65.59 
 
 
424 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  60.95 
 
 
420 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  60.41 
 
 
426 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  60.41 
 
 
426 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  60.41 
 
 
426 aa  475  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  60.66 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  60.66 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  60.66 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  60.66 
 
 
426 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  61.24 
 
 
409 aa  455  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 
438 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  56.4 
 
 
438 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  60.36 
 
 
437 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5000  major facilitator transporter  60.35 
 
 
429 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  55.7 
 
 
422 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  56.17 
 
 
417 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2072  major facilitator transporter  59.19 
 
 
427 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314565  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  57.58 
 
 
439 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  49.14 
 
 
425 aa  401  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  49.01 
 
 
431 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  49.01 
 
 
431 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  45.91 
 
 
912 aa  346  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  47.79 
 
 
895 aa  345  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 
443 aa  343  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  44.85 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  46.39 
 
 
453 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1450  major facilitator transporter  43.98 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.457135  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  43.47 
 
 
905 aa  310  4e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  44.17 
 
 
917 aa  300  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2131  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 
460 aa  299  6e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.876012  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2594  major facilitator transporter  47.42 
 
 
460 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.640218  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5686  major facilitator transporter  45.45 
 
 
459 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365364  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1938  nitrate/nitrite transporter  38.29 
 
 
424 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  41.29 
 
 
402 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3141  major facilitator superfamily transporter  43.6 
 
 
452 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2640  major facilitator transporter  38.29 
 
 
424 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148312  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03875  Nitrate/nitrite transporter  38.44 
 
 
431 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.846133  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1453  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
413 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.872664  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  46.54 
 
 
893 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1630  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 
422 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0458423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0246  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 
444 aa  266  5e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121855  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  43.8 
 
 
424 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0176  major facilitator transporter  37.44 
 
 
472 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167019  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0191  major facilitator transporter  36.98 
 
 
472 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000226974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0207  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 
506 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4629  major facilitator transporter  38.64 
 
 
494 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3087  major facilitator superfamily transporter  31.94 
 
 
419 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2389  major facilitator transporter  38.02 
 
 
411 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 
398 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  30 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  29.74 
 
 
389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  30 
 
 
389 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  30 
 
 
389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  33.97 
 
 
397 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  29.74 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  29.74 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  29.74 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  29.74 
 
 
389 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  29.74 
 
 
389 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 
397 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  33.42 
 
 
404 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 
382 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  33.06 
 
 
406 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  32.26 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  29.1 
 
 
389 aa  164  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  31.44 
 
 
423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  31.4 
 
 
406 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  31.13 
 
 
406 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  31.13 
 
 
406 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  29.61 
 
 
404 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  31.4 
 
 
403 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
400 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  31.72 
 
 
403 aa  159  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  31.05 
 
 
403 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  30.34 
 
 
403 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  30.05 
 
 
403 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  34.57 
 
 
401 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  31.71 
 
 
390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2155  major facilitator transporter  30.65 
 
 
418 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.178269  decreased coverage  0.00520105 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  39.38 
 
 
394 aa  152  8.999999999999999e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  32.35 
 
 
424 aa  150  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>