210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2368 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  100 
 
 		 345 aa  713    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4012  methyltransferase type 12  35.32 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0441  methyltransferase type 11  32.27 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.03827 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  31.3 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  38.27 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  31.37 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 		 238 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 410 aa  52.8  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.69 
 
 		 239 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.7 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34 
 
 		 246 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  31.25 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 213 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  29.69 
 
 		 242 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 238 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.69 
 
 		 229 aa  50.1  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  50.1  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  30.15 
 
 		 253 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2291  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.08 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.38812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 		 247 aa  49.7  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 235 aa  49.3  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1389  methyltransferase type 12  25.29 
 
 		 2112 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 247 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  31.68 
 
 		 541 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4072  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3244  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  39.02 
 
 		 355 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.618843 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  33.01 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0905  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  32.1 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.56455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  27.48 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  33.01 
 
 		 541 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 266 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  27.78 
 
 		 195 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.04 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  29.21 
 
 		 414 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2287  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.68 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.46 
 
 		 276 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.13 
 
 		 345 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.68 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2658  methyltransferase type 12  38.67 
 
 		 121 aa  47  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.774781  normal  0.0322757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  33.01 
 
 		 541 aa  47  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.56 
 
 		 253 aa  47  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  25.87 
 
 		 327 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  27 
 
 		 264 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 		 244 aa  47  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.29 
 
 		 230 aa  46.6  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.43 
 
 		 249 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4117  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0846884  normal  0.805423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2816  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.218226  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  30.77 
 
 		 222 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 270 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0535  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.77555  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  31.73 
 
 		 450 aa  46.2  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.94 
 
 		 229 aa  46.6  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  37.84 
 
 		 262 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  28.83 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  35.79 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.62 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.93 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 226 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  27.48 
 
 		 206 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.79 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2458  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 581 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1096  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5162  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.21 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 		 190 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4697  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  27.21 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  28.83 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  22.22 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  28.83 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  33.9 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  33.68 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0191  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltrans ferase  34.15 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.28 
 
 		 230 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0121  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.37 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.83628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  33.68 
 
 		 318 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.89 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  29.01 
 
 		 198 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0299  precorrin-6Y C5,15-methyltransferase (decarboxylating), CbiT subunit  27.19 
 
 		 189 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.56429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  24.8 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.67 
 
 		 298 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4414  aryl-alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>