More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2284 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2284  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  100 
 
 
198 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.278877  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  87.96 
 
 
196 aa  306  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  72.92 
 
 
196 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3030  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  75.52 
 
 
196 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  72.4 
 
 
197 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4727  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  70.56 
 
 
198 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3529  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  72.73 
 
 
203 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.536272  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.83 
 
 
201 aa  236  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  63.78 
 
 
203 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1357  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  66.85 
 
 
203 aa  220  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0473  hypothetical protein  70.05 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537999  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  55.17 
 
 
214 aa  210  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0601  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.34 
 
 
201 aa  207  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0566  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.82 
 
 
201 aa  205  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1389  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  61.98 
 
 
206 aa  204  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.942836  normal  0.154079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3514  protein of unknown function DUF205  66.32 
 
 
202 aa  202  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.132089  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1297  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  60.42 
 
 
206 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114938  hitchhiker  0.00391908 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3637  protein of unknown function DUF205  65.62 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.646526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3314  hypothetical protein  66.15 
 
 
202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1760  hypothetical protein  57.73 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  56.45 
 
 
210 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3856  protein of unknown function DUF205  57 
 
 
204 aa  190  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0565232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3420  hypothetical protein  62.37 
 
 
197 aa  188  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296095  normal  0.610432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1004  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  57.84 
 
 
201 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134889  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2664  hypothetical protein  57.84 
 
 
201 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3917  hypothetical protein  66.67 
 
 
202 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3095  protein of unknown function DUF205  56.83 
 
 
203 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0484205  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4346  hypothetical protein  71.27 
 
 
199 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2553  hypothetical protein  56.99 
 
 
194 aa  181  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  49.74 
 
 
211 aa  176  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1715  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  54.89 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.23261  normal  0.276214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1643  protein of unknown function DUF205  53.92 
 
 
212 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1208  hypothetical protein  54.3 
 
 
200 aa  158  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3073  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  55.56 
 
 
202 aa  158  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306378  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  53.51 
 
 
203 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1509  hypothetical protein  54.21 
 
 
215 aa  156  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3906  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.93 
 
 
203 aa  155  4e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.676022  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3192  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  53.65 
 
 
216 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3312  protein of unknown function DUF205  71.11 
 
 
200 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0040  hypothetical protein  51.63 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.828352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1800  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.78 
 
 
197 aa  145  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.428645  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  50.28 
 
 
192 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2062  hypothetical protein  48.42 
 
 
202 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  45.95 
 
 
196 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  46.7 
 
 
226 aa  142  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.72 
 
 
212 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.88 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  46.52 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  47.4 
 
 
198 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0517  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.6 
 
 
202 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0870487  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.63 
 
 
189 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  43.15 
 
 
209 aa  139  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  44.02 
 
 
224 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.88 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.94 
 
 
203 aa  138  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  41.83 
 
 
216 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0541  hypothetical protein  51.11 
 
 
192 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001618  acyl-phosphate:glycerol-3-phosphate O-acyltransferase PlsY  42.86 
 
 
203 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0411697  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.04 
 
 
226 aa  136  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0320  protein of unknown function DUF205  44.62 
 
 
208 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.254648  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.08 
 
 
210 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0575  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  45.26 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.24732  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  37.7 
 
 
195 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0293  hypothetical protein  43.01 
 
 
210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2329  hypothetical protein  48.97 
 
 
197 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0425  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  48.28 
 
 
189 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.954266  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.85 
 
 
203 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0007  membrane protein  42.39 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.386788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.93 
 
 
215 aa  134  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2753  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.01 
 
 
206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.329703  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2243  protein of unknown function DUF205  43.01 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.7 
 
 
189 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.134868  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0391  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.13 
 
 
189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.566862  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  46.35 
 
 
198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  46.15 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.01 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2546  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.62 
 
 
207 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2382  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  45.79 
 
 
200 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.332777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.03 
 
 
213 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2823  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.83 
 
 
207 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.571241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4296  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  42.56 
 
 
212 aa  131  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0033487  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4024  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  49.73 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.94 
 
 
211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1077  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.76 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.116934  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  37.3 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.51 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.22 
 
 
203 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.9 
 
 
208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2417  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.83 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  38.97 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.22 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.22 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  36.41 
 
 
196 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  46.74 
 
 
193 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.22 
 
 
203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  49.44 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0918  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  47.62 
 
 
203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0740  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  46.03 
 
 
212 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>