More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2187 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2187  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1751  3-dehydroquinate dehydratase  88.46 
 
 		 156 aa  284  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0911231  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2867  3-dehydroquinate dehydratase  85.71 
 
 		 151 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2715  3-dehydroquinate dehydratase  80.95 
 
 		 151 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2433  3-dehydroquinate dehydratase  77.78 
 
 		 156 aa  244  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4214  3-dehydroquinate dehydratase  78.62 
 
 		 163 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3018  3-dehydroquinate dehydratase  76.03 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 		 148 aa  184  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  60.27 
 
 		 148 aa  183  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  56.94 
 
 		 152 aa  181  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4902  3-dehydroquinate dehydratase  57.24 
 
 		 146 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  61.87 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  56.64 
 
 		 146 aa  174  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03030  3-dehydroquinate dehydratase  55.78 
 
 		 148 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.343672  hitchhiker  0.0000797805 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  54.42 
 
 		 151 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  59.86 
 
 		 153 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2299  3-dehydroquinate dehydratase  59.72 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.926726  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  57.64 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  56.08 
 
 		 150 aa  170  5.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  56.25 
 
 		 147 aa  170  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  61.97 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3288  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 152 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.796587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0330  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 148 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.7522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  56.12 
 
 		 147 aa  167  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  57.75 
 
 		 149 aa  167  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.79 
 
 		 150 aa  166  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1397  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000192408  normal  0.601404 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  57.45 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.88 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1913  3-dehydroquinate dehydratase  57.97 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.643127  normal  0.307548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 145 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2041  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2433  3-dehydroquinate dehydratase  55.17 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.587468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 153 aa  163  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  54.61 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  51.8 
 
 		 150 aa  163  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3500  3-dehydroquinate dehydratase  55.24 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.651593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  56.03 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0579  3-dehydroquinate dehydratase  57.04 
 
 		 193 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0482  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 193 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.644593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1896  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 193 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2207  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0892  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0849  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1753  3-dehydroquinate dehydratase  56.34 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111772  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2272  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 176 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156045  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0908  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0904  3-dehydroquinate dehydratase  53.85 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.92679  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1714  3-dehydroquinate dehydratase  57.78 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.011115  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5950  3-dehydroquinate dehydratase  51.33 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0375239  normal  0.0174964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21280  3-dehydroquinate dehydratase  55.56 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.775201  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 146 aa  158  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2377  3-dehydroquinate dehydratase  59.42 
 
 		 149 aa  157  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  52.35 
 
 		 156 aa  156  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  56.52 
 
 		 146 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4133  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.06 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.817948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3419  3-dehydroquinate dehydratase  57.25 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0105986  normal  0.197082 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 146 aa  154  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  53.52 
 
 		 149 aa  154  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1267  3-dehydroquinate dehydratase  50.68 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0717044  hitchhiker  0.00235053 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.15 
 
 		 144 aa  153  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7090  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 147 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2054  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  55.8 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  54.55 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.82 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.86 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.09 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.07 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  51.02 
 
 		 149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1848  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 143 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  55.07 
 
 		 151 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  52.86 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1437  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 146 aa  150  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0623689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  54.29 
 
 		 160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 		 145 aa  150  8e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.68 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  54.74 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.08 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1841  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 143 aa  148  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.226528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2566  3-dehydroquinate dehydratase  51.7 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3143  3-dehydroquinate dehydratase type II  52.86 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.993688  hitchhiker  0.00640997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  54.68 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.99 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  148  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03007  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.48 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>