More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2180 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  63.67 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  65.41 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  63.2 
 
 		 272 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  66.04 
 
 		 273 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  59.04 
 
 		 274 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  58.67 
 
 		 274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  61.03 
 
 		 275 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  55.68 
 
 		 280 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  61.57 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  56.09 
 
 		 279 aa  281  8.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  56.54 
 
 		 280 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  59.53 
 
 		 279 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  55.35 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  51.89 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  52.08 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  52.79 
 
 		 276 aa  249  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50.19 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  50.57 
 
 		 276 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  47.94 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  48.72 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.19 
 
 		 276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  53.52 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  49.08 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  51.39 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  46.47 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  49.81 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  52.73 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  46.18 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  50.76 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  50.38 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  50.38 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  53.03 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  43.8 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  44.96 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  43.07 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  43.18 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  44.98 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  53.03 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  51.3 
 
 		 286 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  44.62 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  44 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  44.11 
 
 		 275 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  48.25 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  41.73 
 
 		 288 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  37.41 
 
 		 276 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  43.12 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  37.69 
 
 		 271 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  32.44 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  37.09 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  35.51 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  28.81 
 
 		 274 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  28.81 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  37.93 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.59 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  31.62 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.98 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  30.89 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.12 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  30.4 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.22 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  33.46 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  35.4 
 
 		 255 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.21 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  33.89 
 
 		 256 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.05 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.08 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  30.52 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  30.49 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  30.2 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  27.06 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  38.43 
 
 		 258 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  33.91 
 
 		 425 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  27.23 
 
 		 266 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  32.63 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  29.6 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  35.27 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  32.02 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  36.17 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  28.51 
 
 		 282 aa  92  9e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.04 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2982  PEP phosphonomutase  33.72 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  36 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  29.13 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  33.9 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  33.19 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  29.96 
 
 		 266 aa  85.9  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  33.48 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  33.48 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  33.48 
 
 		 252 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  28.25 
 
 		 267 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  30.88 
 
 		 269 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  31.93 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12660  PEP phosphonomutase-like enzyme  34.14 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  33.18 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.39 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  27.01 
 
 		 286 aa  79  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  29.41 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  27.01 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  31.86 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>