173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2003 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2003  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  556  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.178183  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5241  putative transposase of insertion sequence  68.18 
 
 		 168 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3994  transposase  62.14 
 
 		 315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3697  transposase and inactivated derivatives-like protein  60.78 
 
 		 188 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3830  transposase  62.38 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3006  transposase  61.76 
 
 		 314 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0864202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1044  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.52 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6904  transposase and inactivated derivatives-like protein  64.37 
 
 		 188 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0093  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.52 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3596  hypothetical protein  64.04 
 
 		 132 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09550  transposase  63.04 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.303396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25130  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33560  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0389  transposase  56.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1789  transposase  56.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0577152  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2717  transposase  56.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2829  transposase  56.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4425  transposase  56.31 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.418617  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17150  Transposase protein  63.64 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0324984  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21760  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0919758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45800  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30220  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13540  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3417  hypothetical protein  69.62 
 
 		 135 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13570  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44670  ISRm2011-2 transposase-like protein  63.64 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.535803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00700  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23930  transposase  63.64 
 
 		 213 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36130  transposase of insertion sequence ISRm10-1, orfB C-terminus protein  62.5 
 
 		 169 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5052  transposase  59.09 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5445  transposase  59.09 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.242552 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6113  transposase  59.09 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6258  transposase  59.09 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0699861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1824  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.658679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2083  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0776544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0141  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0348  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0604591  hitchhiker  0.00292274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0410  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000395058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1240  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0720476  normal  0.411655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3636  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0772273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4034  putative transposase of insertion sequence ISRm10-1  56.82 
 
 		 158 aa  112  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  0.491581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0232  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0363  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898022 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0483  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0654  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0707  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.327087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0851  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0492095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1315  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1396  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.05552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1968  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2029  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2060  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.322885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2104  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2108  transposase for insertion sequence element ISRM11/ISRM2011-2  58.89 
 
 		 227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2370  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2847  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2949  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3008  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1157  ISRm2011-2 transposase protein  58.89 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0237773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6023  transposase  57.78 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.014729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1104  transposase  57.78 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.785003 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0803  putative ISRm2011-2 transposase protein  58.7 
 
 		 169 aa  108  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248084 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5976  transposase  56.67 
 
 		 283 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2724  Transposase IS630  60.92 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.35712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2359  transposase IS630  60.92 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2836  transposase IS630  60.92 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2200  ISRm2011-2 transposase protein  57.95 
 
 		 188 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.415704  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8190  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8444  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4407  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0585  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0631  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866083  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3455  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6428  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7501  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.602331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6832  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2127  putative transposase of insertion sequence  73.77 
 
 		 115 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0218994  normal  0.27954 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0125  ISRm2011-2 transposase protein  57.95 
 
 		 157 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1434  ISRm2011-2 transposase protein  57.95 
 
 		 157 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.575144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2693  ISRm2011-2 transposase protein  57.95 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3109  ISRm2011-2 transposase protein  57.95 
 
 		 188 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0367059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3554  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3909  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5622  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6255  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6152  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6103  putative transposase of insertion sequence  57.95 
 
 		 173 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5181  putative transposase of insertion sequence  52.27 
 
 		 191 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2489  ISRm2011-2 transposase protein  56.82 
 
 		 157 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.336252  normal  0.806618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1417  ISRm2011-2 transposase protein  55.68 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1107  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.803868  normal  0.326168 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1849  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.10898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4579  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3560  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.967401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4731  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.764238  hitchhiker  0.00516729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0376  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0668  transposase and inactivated derivatives-like protein  56.32 
 
 		 167 aa  99.8  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1090  Transposase and inactivated derivatives-like protein  53.41 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4703  transposase IS630-like protein  61.64 
 
 		 183 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0112849  normal  0.955006 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1291  ISRm2011-2 transposase protein  46.24 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.950102  normal  0.580974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2921  ISRm2011-2 transposase protein  46.24 
 
 		 238 aa  97.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.653073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>