41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1930 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  312  9e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  47.62 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  51.01 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  42.95 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  46.21 
 
 		 149 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  44.76 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  40.85 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  39.73 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  41.3 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  38.62 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  59.21 
 
 		 83 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  41.43 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  32.62 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  31.91 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  30.66 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  30.5 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  41.11 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  31.3 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  27.7 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  27.08 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  33.33 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  34.02 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  29.13 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  31.21 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0562  hypothetical protein  31.63 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  26.47 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  27.82 
 
 		 167 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  26.53 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1237  hypothetical protein  32.88 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  27.27 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  27.74 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3609  hypothetical protein  29.73 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1980  AtsE  24.64 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1145  host cell attachment-required protein  27.07 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  33.33 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3521  AtsE protein  36.84 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5481  hypothetical protein  37.88 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.222259  normal  0.850056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>