More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1903 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  39.46 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  39.04 
 
 		 196 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  44.62 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  39.57 
 
 		 194 aa  131  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  47.93 
 
 		 191 aa  130  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  47.93 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  35.26 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  34.41 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  32.09 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  34.59 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  31.11 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  31.91 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  29.32 
 
 		 189 aa  95.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  34.97 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  35.66 
 
 		 188 aa  94.7  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  29.84 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25.99 
 
 		 345 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  33.9 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.02 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  28.19 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  33.57 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.97 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1523  NAD(P)H-flavin oxidoreductase, putative  31.31 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  34.52 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  28.74 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  30 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  30.65 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  27.93 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  31.49 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  27.33 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  30.11 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.9 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  35.76 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  26.74 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.52 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  29.78 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  26.74 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  30.46 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  29.78 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  31.29 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  27.33 
 
 		 173 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  28.65 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  29.44 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  32.79 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  28.65 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  31.69 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  31.05 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  34.07 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.15 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  31.82 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  32.2 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  28.65 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  30.77 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.52 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  32.26 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  35.12 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  31.89 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  28.07 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  28.72 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  33.08 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  31.72 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  30.43 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  27.38 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  32.8 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  30.21 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.07 
 
 		 167 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  30.53 
 
 		 176 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  29.17 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.81 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  29.89 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  26.83 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  30.23 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  32.45 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  30.43 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  29.71 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  28.32 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  27.81 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  29.93 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  30.39 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.19 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  29.5 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  27.98 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  26.26 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  28.68 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.12 
 
 		 334 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  34.09 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  33.58 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  31.18 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  27.04 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  27.07 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  27.22 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  30.81 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0445  nitroreductase  27.66 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.861043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  28.98 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  28.83 
 
 		 167 aa  62.8  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  24.77 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  30.81 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1363  nitroreductase  30.9 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>