More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1842 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2868  GTP-binding proten HflX  80.37 
 
 		 455 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1450  GTP-binding protein, HSR1-related  88.51 
 
 		 442 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.475087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2877  GTP-binding protein, HSR1-related  81.61 
 
 		 457 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2583  GTP-binding protein, HSR1-related  81.67 
 
 		 461 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0894246  normal  0.17165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2595  GTP-binding protein, HSR1-related  81.25 
 
 		 434 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0324515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1842  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 444 aa  894    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4074  putative GTP-binding protein (hflX)  82.05 
 
 		 459 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4392  small GTP-binding protein  63.76 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5943  GTP-binding proten HflX  63.34 
 
 		 474 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6545  GTP-binding proten HflX  63.34 
 
 		 471 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2943  GTP-binding proten HflX  61.75 
 
 		 471 aa  487  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3052  GTP-binding proten HflX  60.83 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2825  GTP-binding proten HflX  60.83 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.162481 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0536  GTP-binding proten HflX  60.74 
 
 		 469 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1494  GTP-binding proten HflX  60.18 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669095  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1526  GTP-binding proten HflX  59.45 
 
 		 466 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0068  GTP-binding proten HflX  59.78 
 
 		 474 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.943914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1069  GTP-binding proten HflX  57.34 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1110  GTP-binding protein, putative  57.57 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.259751  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1685  small GTP-binding protein domain-containing protein  58.65 
 
 		 418 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2207  GTP-binding protein HSR1-related  56.42 
 
 		 472 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2142  GTP-binding protein HFLX  56.06 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.501341  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1633  GTP-binding proten HflX  56.49 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192278  normal  0.293033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1096  GTP-binding protein HSR1-related  57.18 
 
 		 465 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.774913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1820  GTP-binding proten HflX  56.44 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0332414  normal  0.106789 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3123  GTP-binding protein HSR1-related  57.39 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1449  small GTP-binding protein  52.36 
 
 		 450 aa  414  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.948671  hitchhiker  0.000728125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1612  GTP-binding protein, HSR1-related  55.29 
 
 		 460 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0252  GTP-binding protein, HSR1-related  58.54 
 
 		 442 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.240813  normal  0.141615 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2611  GTP-binding proten HflX  56.06 
 
 		 446 aa  396  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.182167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1761  GTP-binding protein, HSR1-related  55.61 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1355  GTP-binding protein, HSR1-related  54.52 
 
 		 423 aa  391  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.427111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1932  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.99 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0481  GTP-binding proten HflX  55.14 
 
 		 436 aa  388  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  decreased coverage  0.000424503 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0625  GTP-binding proten HflX  52.06 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00182649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1271  GTP-binding protein, HSR1-related  54.79 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.51955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1566  GTP-binding protein  54.08 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal  0.0486132 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1450  small GTP-binding protein  53.52 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0438949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2844  putative GTP-binding protein  53.52 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4123  small GTP-binding protein  54.52 
 
 		 435 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.214153  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2245  GTP-binding protein, HSR1-related  51.56 
 
 		 435 aa  359  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.157865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1494  GTP-binding protein, HSR1-related  53.87 
 
 		 448 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.172375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0278  GTP-binding protein, HSR1-related  52.07 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.134684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1408  GTP-binding proten HflX  45.13 
 
 		 441 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2012  GTP-binding proten HflX  48.87 
 
 		 440 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1885  GTP-binding protein HflX  48.4 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0816139  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1560  GTP-binding proten HflX  48.4 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000698014 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2926  GTP1/OBG protein  45.48 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0180067  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00154  GTP-binding protein  46.76 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2768  GTP-binding protein, HSR1-related  47.21 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1982  GTP-binding protein  46.83 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.699413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5672  GTP-binding proten HflX  48.73 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0497  GTP-binding proten HflX  47.59 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.135524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2721  GTP-binding proten HflX  45.36 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.43015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65300  putative GTP-binding protein  48.44 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0898  GTP-binding proten HflX  45.77 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.105158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002260  GTP-binding protein HflX  51.41 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3097  GTP-binding proten HflX  48.08 
 
 		 461 aa  285  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  normal  0.400149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0574  GTP-binding protein, HSR1-related  47.92 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227405  hitchhiker  0.000000000264606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2979  GTP-binding protein, HSR1-related  52.09 
 
 		 384 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.908653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  45.81 
 
 		 489 aa  284  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2776  putative GTPase HflX  50.47 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1472  GTP-binding proten HflX  45.62 
 
 		 436 aa  283  5.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  51.86 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  45.53 
 
 		 489 aa  283  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2334  small GTP-binding protein  49.57 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4893  GTP-binding protein HflX  49.86 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4769  GTP-binding protein, HSR1-related  49.86 
 
 		 433 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3024  GTP-binding protein HflX  47.5 
 
 		 435 aa  282  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000099061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00093  putative GTPase HflX  50.78 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4945  GTP-binding proten HflX  49.86 
 
 		 433 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0636  GTP-binding protein, HSR1-related  47.59 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0477069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3144  small GTP-binding protein  49.57 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000830464  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0010  hypothetical protein  42.25 
 
 		 414 aa  280  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0010  hypothetical protein  42 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1731  GTP-binding proten HflX  42.89 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2759  putative GTPase HflX  49.53 
 
 		 429 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.563886  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1048  GTP-binding protein  43.8 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0940  GTP-binding proten HflX  43.8 
 
 		 454 aa  277  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_1719  predicted protein  41.09 
 
 		 415 aa  277  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0069  GTP-binding protein  44.59 
 
 		 450 aa  276  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3310  GTP-binding protein, HSR1-related  44.96 
 
 		 435 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0057  GTP-binding proten HflX  44.59 
 
 		 450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.583436  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1469  GTP-binding proten HflX  48.28 
 
 		 396 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.795442  normal  0.339069 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00650  GTP-binding protein HflX  48.31 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1278  GTP-binding protein, HSR1-related  54.61 
 
 		 439 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.424036  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2589  GTP-binding protein, HSR1-related  47.4 
 
 		 382 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1414  GTP-binding proten HflX  48.85 
 
 		 414 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000434774 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1600  small GTP-binding protein  46.4 
 
 		 404 aa  273  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0793347  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3979  GTP-binding protein, HSR1-related  47.88 
 
 		 432 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2535  GTP-binding proten HflX  47.99 
 
 		 404 aa  272  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0955087  hitchhiker  0.0000726108 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0536  putative GTPase HflX  44.86 
 
 		 426 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000302275  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1713  GTP-binding proten HflX  44.35 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.639031  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2666  putative GTP-binding protein  44.88 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3204  GTP-binding protein, HSR1-related  46.63 
 
 		 435 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04040  predicted GTPase  45.87 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.188583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3840  putative GTPase HflX  45.87 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.209609  hitchhiker  0.000000230034 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0446  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.47 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5689  putative GTPase HflX  45.87 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0600434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4731  putative GTPase HflX  45.87 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>