More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1756 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  100 
 
 
110 aa  219  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  96.36 
 
 
110 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  84.55 
 
 
110 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  82.73 
 
 
110 aa  190  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  83.64 
 
 
110 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  87.38 
 
 
113 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  83.02 
 
 
109 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  65.42 
 
 
108 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  64.49 
 
 
108 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  58.18 
 
 
110 aa  145  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  64.49 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  64.49 
 
 
108 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2770  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.86 
 
 
108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.294357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  62.26 
 
 
108 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  55.45 
 
 
110 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.81 
 
 
108 aa  136  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.55 
 
 
109 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  58.18 
 
 
110 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3701  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.38 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3392  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60.38 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3020  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  59.81 
 
 
116 aa  133  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  60 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0493  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.63 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2712  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.46 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1678  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.55 
 
 
110 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0751  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.118128  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4243  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.83 
 
 
141 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1156  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.27 
 
 
109 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293906  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1781  HesB/YadR/YfhF  56.99 
 
 
124 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1196  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.4 
 
 
108 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0627654  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1316  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.46 
 
 
108 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2658  HesB/YadR/YfhF family protein  51.46 
 
 
108 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0379695  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  45.95 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.06 
 
 
111 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0928  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  57.14 
 
 
111 aa  113  8.999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48 
 
 
102 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.87 
 
 
128 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.95 
 
 
130 aa  110  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1730  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  54.29 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146386  normal  0.864334 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.04 
 
 
128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  41.67 
 
 
113 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.87 
 
 
116 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  45.71 
 
 
117 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.53 
 
 
115 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.6 
 
 
122 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.05 
 
 
116 aa  104  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  48.11 
 
 
117 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0901  HesB/YadR/YfhF  52.43 
 
 
107 aa  104  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
120 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.63 
 
 
121 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
121 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
121 aa  103  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1504  HesB/YadR/YfhF  49.51 
 
 
109 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.1 
 
 
121 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0047  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.22 
 
 
109 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
132 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
121 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.14 
 
 
132 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
121 aa  102  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3299  HesB/YadR/YfhF  46.23 
 
 
117 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  48.15 
 
 
122 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.23 
 
 
122 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.66 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.12 
 
 
116 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
124 aa  102  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.45 
 
 
124 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.95 
 
 
116 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
121 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.69 
 
 
123 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.34 
 
 
116 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  41.51 
 
 
116 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  43.24 
 
 
116 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.24 
 
 
116 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  42.86 
 
 
121 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
121 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.86 
 
 
120 aa  100  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
124 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  48.57 
 
 
107 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  40.78 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  42.59 
 
 
116 aa  99.8  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  39.62 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0445  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.02 
 
 
123 aa  99  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.361267  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>