65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1481 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  348  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  82.76 
 
 		 174 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  66.86 
 
 		 169 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  67.65 
 
 		 169 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  64.74 
 
 		 173 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  66.27 
 
 		 169 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  58.86 
 
 		 175 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  36.64 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2299  hypothetical protein  28.26 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00163404  hitchhiker  0.00316574 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2574  hypothetical protein  28.26 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0806322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  29.88 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2255  hypothetical protein  25.41 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0302471  normal  0.290455 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1572  hypothetical protein  32.08 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0621324  normal  0.847942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  30.41 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2698  hypothetical protein  28.78 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703285  normal  0.0769934 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0880  hypothetical protein  26.17 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.574184  normal  0.149249 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4778  hypothetical protein  26.27 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.241672  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  36.62 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  34.16 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  48.21 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  34.16 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4668  hypothetical protein  27.66 
 
 		 180 aa  57  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  27.48 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  27.48 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  41.33 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  41.33 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  41.33 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  28.17 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  47.17 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0121  hypothetical protein  24 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  25.18 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  28.37 
 
 		 180 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  52.94 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  47.5 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  29.17 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  45 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  45.83 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.112746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  22 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  41.18 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2577  signal peptide protein  47.62 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  39.71 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0714  putative signal peptide protein  45.24 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1988  hypothetical protein  34.48 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.830663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3141  hypothetical protein  35.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524647  normal  0.415075 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  43.24 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02106  hypothetical protein  31.43 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.485695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2999  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.796901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4154  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0434  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.733468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2950  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.149218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1633  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0975  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.792265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3008  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.439263  normal  0.0175775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0562  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.034618  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1000  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0917  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0981814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1041  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2263  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2577  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0952  hypothetical protein  40.43 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2887  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0196  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0921  hypothetical protein  40.43 
 
 		 199 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.189751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  38.46 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>