More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1374 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1117  patatin  82.29 
 
 		 621 aa  1010    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.142446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1374  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 		 624 aa  1253    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.138128  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3179  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1737  cyclic nucleotide-binding protein  32.39 
 
 		 584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.987776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3155  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 599 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  32.05 
 
 		 583 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0922  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.22 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02481  Lysophospholipase nte1 (EC 3.1.1.5)(Neuropathy target esterase homolog)(Intracellular phospholipase B) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAE9]  30.15 
 
 		 1408 aa  216  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0963788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2455  cyclic nucleotide-binding protein  32.08 
 
 		 594 aa  208  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3195  cyclic nucleotide-binding protein  32.35 
 
 		 598 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0617  cyclic nucleotide-binding protein  33.22 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04180  hydrolase, putative  27.54 
 
 		 1588 aa  196  9e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 748 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18298  predicted protein  30.99 
 
 		 1275 aa  184  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13268  transmembrane transport protein  29.53 
 
 		 1048 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.321047 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30628  predicted protein  28.74 
 
 		 1085 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12585  hypothetical protein  26.73 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.274213  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13760  hypothetical protein  28.55 
 
 		 1065 aa  151  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.217439 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.72 
 
 		 760 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  34.09 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  34.93 
 
 		 738 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.76 
 
 		 323 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  30.3 
 
 		 310 aa  117  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  29.32 
 
 		 335 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2711  hypothetical protein  31.4 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.415635  hitchhiker  0.000234517 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33358  predicted protein  29.54 
 
 		 1546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.176236 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  31.29 
 
 		 311 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  34.89 
 
 		 738 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  34.89 
 
 		 738 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  34.17 
 
 		 737 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  34.17 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  34.17 
 
 		 738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  26.62 
 
 		 740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.96 
 
 		 754 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  34.53 
 
 		 736 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  33.81 
 
 		 738 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  34.53 
 
 		 739 aa  112  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  29.35 
 
 		 315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1960  hypothetical protein  31.03 
 
 		 300 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  35.13 
 
 		 738 aa  111  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  32.69 
 
 		 727 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  31.07 
 
 		 734 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  31.58 
 
 		 735 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  35.86 
 
 		 327 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2263  patatin  32.23 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.622551  normal  0.202768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  28.82 
 
 		 263 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  32.57 
 
 		 354 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  28.77 
 
 		 301 aa  108  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2538  Patatin  40.74 
 
 		 352 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.54485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  28.48 
 
 		 314 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3230  patatin  32.09 
 
 		 352 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000670188  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.92 
 
 		 735 aa  107  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  32.04 
 
 		 728 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.18 
 
 		 263 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  38.17 
 
 		 320 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  28.42 
 
 		 301 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  32.35 
 
 		 751 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  29.77 
 
 		 303 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  34.92 
 
 		 263 aa  106  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  31.39 
 
 		 728 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  32.42 
 
 		 323 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  29.8 
 
 		 767 aa  105  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  28.42 
 
 		 301 aa  105  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  31.94 
 
 		 300 aa  104  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.09 
 
 		 741 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  34.39 
 
 		 263 aa  103  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  27.43 
 
 		 263 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.19 
 
 		 728 aa  103  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  28.08 
 
 		 707 aa  103  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  27.43 
 
 		 263 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  30.19 
 
 		 667 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  36.23 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.43 
 
 		 263 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  31.7 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  27.13 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2220  Patatin  39.68 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0960823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  27.08 
 
 		 263 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  27.08 
 
 		 263 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  30.74 
 
 		 733 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  27.08 
 
 		 263 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.02 
 
 		 740 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  28.99 
 
 		 790 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  29.03 
 
 		 250 aa  101  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  26.74 
 
 		 263 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  29.64 
 
 		 301 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  31.34 
 
 		 775 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1944  hypothetical protein  28.87 
 
 		 301 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.84 
 
 		 304 aa  100  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  30.1 
 
 		 321 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  34.55 
 
 		 368 aa  99.8  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  33.49 
 
 		 803 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  33.49 
 
 		 803 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  33.49 
 
 		 803 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.6 
 
 		 333 aa  99.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>