51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1373 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  52.51 
 
 		 261 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  35.32 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  35.32 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  33.73 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  30.56 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  34.56 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  31.25 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  36.84 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  33.87 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  33.87 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  33.87 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  29.32 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  30.13 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  30.2 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  27.87 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  32.23 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  32 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.38 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  35 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  30.14 
 
 		 156 aa  49.7  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  26.49 
 
 		 188 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  28.83 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  35.78 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  26.49 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2449  protein of unknown function DUF955  30.4 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  36.84 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  30.43 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  28.5 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  25.93 
 
 		 367 aa  46.2  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  28.1 
 
 		 267 aa  45.8  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0729  hypothetical protein  26.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  25.41 
 
 		 367 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0733  hypothetical protein  26.67 
 
 		 435 aa  45.4  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0252542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  29.61 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  34.23 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  29.73 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  32 
 
 		 346 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199018 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  31.68 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  26.75 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  31.39 
 
 		 216 aa  43.5  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.92 
 
 		 174 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  28 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  45.9 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  45.9 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3868  protein of unknown function DUF955  30.07 
 
 		 173 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00178055  normal  0.0152146 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  33.04 
 
 		 410 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  31.29 
 
 		 168 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  33.87 
 
 		 350 aa  42  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>