166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1311 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  100 
 
 
265 aa  549  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1083  metallophosphoesterase  90.57 
 
 
278 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4491  metallophosphoesterase  83.4 
 
 
265 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1630  metallophosphoesterase  81.51 
 
 
265 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.410034  normal  0.983141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1621  metallophosphoesterase  81.51 
 
 
270 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5563  putative UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase  80.61 
 
 
270 aa  455  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419435  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1445  metallophosphoesterase  80.83 
 
 
266 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0245268  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4108  metallophosphoesterase  70.87 
 
 
269 aa  387  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.575932  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2198  metallophosphoesterase  67.33 
 
 
280 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1987  metallophosphoesterase  67.33 
 
 
280 aa  354  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.247789  normal  0.642917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3671  metallophosphoesterase  64.71 
 
 
265 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.491584  normal  0.72335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2104  metallophosphoesterase  65.6 
 
 
288 aa  350  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.485376  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  64.23 
 
 
270 aa  345  5e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4942  metallophosphoesterase  61.54 
 
 
301 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1746  metallophosphoesterase  64.75 
 
 
270 aa  337  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.712326  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1557  metallophosphoesterase  60.74 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.118402  normal  0.0847897 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1794  metallophosphoesterase  65.16 
 
 
270 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2130  metallophosphoesterase  64.75 
 
 
270 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1892  hypothetical protein  59.7 
 
 
286 aa  333  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0951  metallophosphoesterase  63.16 
 
 
272 aa  333  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00303704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1538  metallophosphoesterase  63.81 
 
 
273 aa  331  9e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4971  metallophosphoesterase  60.9 
 
 
290 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  61.98 
 
 
310 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1122  metallophosphoesterase  58.73 
 
 
296 aa  319  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1203  metallophosphoesterase  58.73 
 
 
296 aa  318  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0863865  normal  0.652482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4655  metallophosphoesterase  60.49 
 
 
289 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  61.41 
 
 
315 aa  316  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  59.2 
 
 
325 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0267  metallophosphoesterase  59.11 
 
 
276 aa  312  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.868219  normal  0.812156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1993  metallophosphoesterase  60.83 
 
 
322 aa  310  1e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.511822  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0941  metallophosphoesterase  57.94 
 
 
332 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.460665  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1911  metallophosphoesterase  56.97 
 
 
316 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.982767  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2234  metallophosphoesterase  57.26 
 
 
316 aa  304  8.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2083  hypothetical protein  57.09 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  55.43 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2244  metallophosphoesterase  56.68 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976084  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0905  metallophosphoesterase  55.73 
 
 
309 aa  298  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  52.65 
 
 
355 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1585  metallophosphoesterase  57.74 
 
 
268 aa  291  5e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.910907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2293  metallophosphoesterase  53.12 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3236  putative metallo-phosphoesterase  54.09 
 
 
313 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.866208  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1659  metallophosphoesterase  53.12 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2186  metallophosphoesterase  52.27 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.08316  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  52.27 
 
 
330 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2270  metallophosphoesterase  53.12 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.599712  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  54.09 
 
 
313 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.219072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.53 
 
 
312 aa  290  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.16 
 
 
312 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1008  metallophosphoesterase  53.39 
 
 
312 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0140335  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2027  metallophosphoesterase  55 
 
 
315 aa  288  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0129825  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0018  metallophosphoesterase  55.83 
 
 
283 aa  288  7e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.511643  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2242  calcineurin-like phosphoesterase  55 
 
 
268 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0527783  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3548  metallophosphoesterase  55.14 
 
 
267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.204852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1907  hypothetical protein  54.58 
 
 
270 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.490976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1735  metallophosphoesterase  53.97 
 
 
303 aa  279  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0014324  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2562  metallophosphoesterase  54.39 
 
 
280 aa  279  3e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.628499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3595  metallophosphoesterase  51.76 
 
 
273 aa  279  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1799  Ser/Thr protein phosphatase family protein  52.82 
 
 
273 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.173881  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22590  hypothetical protein  53.75 
 
 
270 aa  276  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0224054  hitchhiker  0.000235612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32770  Metallophosphoesterase protein  49.81 
 
 
274 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0637  metallophosphoesterase  51.35 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0426025  normal  0.0997197 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1821  metallophosphoesterase  52.46 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177356  normal  0.924428 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3799  metallophosphoesterase  50.96 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000165478 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1600  metallophosphoesterase  50.21 
 
 
279 aa  271  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1475  metallophosphoesterase  50.19 
 
 
271 aa  271  9e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.328477  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4510  metallophosphoesterase  52.05 
 
 
265 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1401  metallophosphoesterase  51.64 
 
 
265 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159972  normal  0.496045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4016  metallophosphoesterase  52.46 
 
 
270 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000445957 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2925  metallophosphoesterase  54.15 
 
 
275 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1802  metallophosphoesterase  55.46 
 
 
284 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1338  metallophosphoesterase  50.78 
 
 
275 aa  258  7e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535328  normal  0.257841 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1882  metallophosphoesterase  48.54 
 
 
255 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0624812  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1140  metallophosphoesterase  50.39 
 
 
273 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1422  Ser/Thr protein phosphatase family protein  50.39 
 
 
273 aa  241  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2578  metallophosphoesterase  44.81 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0142  metallophosphoesterase  46.22 
 
 
283 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2752  metallophosphoesterase  46.46 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2029  metallophosphoesterase  43.55 
 
 
286 aa  224  9e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000978439  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2266  metallophosphoesterase  42.52 
 
 
300 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3813  calcineurin-like phosphoesterase  43.93 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1405  glycosyl transferase group 1  43.44 
 
 
655 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.873771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1246  metallophosphoesterase  42.28 
 
 
272 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02091  metallophosphoesterase  42.13 
 
 
265 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00183313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0704  metallophosphoesterase  40.84 
 
 
267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2538  metallophosphoesterase  43.37 
 
 
269 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.342013  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0044  metallophosphoesterase  44.67 
 
 
363 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3659  metallophosphoesterase  40.47 
 
 
288 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.0716533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1057  metallophosphoesterase  40.96 
 
 
360 aa  206  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00574405  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1122  metallophosphoesterase  40.16 
 
 
360 aa  205  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1061  metallophosphoesterase  40.73 
 
 
357 aa  205  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3207  metallophosphoesterase  39.23 
 
 
374 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.949256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2809  metallophosphoesterase  40.56 
 
 
355 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3207  metallophosphoesterase  39.23 
 
 
374 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.603863  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3025  metallophosphoesterase  42.44 
 
 
293 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>