113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1256 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1256  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  524  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2447  hypothetical protein  65.22 
 
 		 261 aa  335  5e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0935429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0743  hypothetical protein  58.1 
 
 		 257 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.848227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2243  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  54.55 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.241494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1704  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  52.33 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.332773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1631  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  53.39 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.995531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3659  hypothetical protein  44.36 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2782  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  41.27 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.674441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0910  hypothetical protein  45.45 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1532  beta-lactamase fold-like Zn-dependent hydrolase  39.92 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0065  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  39.76 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9016  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  38.91 
 
 		 259 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  0.212694 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4668  hypothetical protein  39.33 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5751  hypothetical protein  39.45 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4915  putative Zn-dependent hydrolase of beta- lactamase fold family  31.68 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.260692  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  30.6 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  28.84 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  28.15 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2954  Beta-lactamase-like  26.74 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  28.25 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  27.45 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4235  beta-lactamase-like protein  28.19 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3083  hypothetical protein  29.67 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986459 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10421  conserved hypothetical protein  25.59 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.876476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1365  putative secreted protein  27.35 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03523  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.077158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1801  beta-lactamase  28.76 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.204896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3185  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0725  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.340687  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2030  hypothetical protein  29.84 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.746583  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4971  beta-lactamase domain-containing protein  25.86 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2092  hypothetical protein  27.37 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0491509  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2032  hypothetical protein  27.37 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000509701  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03400  hypothetical protein  23.89 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2247  hypothetical protein  27.37 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0231046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3459  hypothetical protein  25.4 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0233834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2277  hypothetical protein  26.84 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00343587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2273  hypothetical protein  27.37 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79645e-45 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1858  hypothetical protein  25.1 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00276087  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1649  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000196619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2358  hypothetical protein  27.23 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000948775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  29.67 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2071  hypothetical protein  26.84 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2597  beta-lactamase-like protein  25.38 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.900625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0526  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2786  hypothetical protein  25.97 
 
 		 392 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.729477  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24223  predicted protein  26.32 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.267509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2230  hypothetical protein  27.57 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00325578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3095  hypothetical protein  27.57 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000159672  hitchhiker  7.43882e-22 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1615  hypothetical protein  28.42 
 
 		 388 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3864  outer membrane protein RomA  30.56 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1708  hypothetical protein  26.3 
 
 		 358 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1482  hypothetical protein  23.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0936  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  22.81 
 
 		 364 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2916  hypothetical protein  27.66 
 
 		 336 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000899  membrane protein  25.7 
 
 		 414 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0737  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.48 
 
 		 364 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.6 
 
 		 590 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1038  hypothetical protein  29.79 
 
 		 403 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1704  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.76 
 
 		 385 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.800105  hitchhiker  0.00545727 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  27.75 
 
 		 325 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0110  hypothetical protein  28.33 
 
 		 350 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2477  exported protein  26.29 
 
 		 250 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102477  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4276  hypothetical protein  26.27 
 
 		 344 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5970  hypothetical protein  27.57 
 
 		 360 aa  49.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1044  hypothetical protein  22 
 
 		 296 aa  49.3  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.228114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  29.67 
 
 		 374 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0420  beta-lactamase fold protein  23.67 
 
 		 258 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00386164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2243  hypothetical protein  28.5 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137529  normal  0.828679 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  25.79 
 
 		 376 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.24 
 
 		 374 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4259  zinc-dependent hydrolase  26.4 
 
 		 363 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04440  metallo hydrolase  29.57 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0190916  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0050  hypothetical protein  24.46 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1021  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.19 
 
 		 312 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.41 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0155  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  22.48 
 
 		 380 aa  45.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00273299  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  25.69 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  25.69 
 
 		 374 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 367 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  26.87 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  27.27 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  25.45 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4430  hypothetical protein  29.77 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4517  hypothetical protein  29.77 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4811  hypothetical protein  29.77 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  24.57 
 
 		 362 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1756  beta-lactamase domain-containing protein  25.5 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  24.44 
 
 		 386 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  25.91 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4305  hypothetical protein  24.42 
 
 		 357 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.12 
 
 		 354 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  27.93 
 
 		 380 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  29.51 
 
 		 371 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  25.45 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2326  hypothetical protein  22.01 
 
 		 309 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0500468 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0722  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  23.08 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.669338  hitchhiker  0.0000193421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.57 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>