154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1196 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  91.71 
 
 		 350 aa  649    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 		 350 aa  717    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  63.16 
 
 		 364 aa  432  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  62.75 
 
 		 361 aa  428  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  58.48 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  57.59 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  58.11 
 
 		 352 aa  412  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  55.94 
 
 		 350 aa  409  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  55.81 
 
 		 349 aa  401  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  54.29 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  54.07 
 
 		 349 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54 
 
 		 358 aa  391  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.59 
 
 		 354 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  50.43 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  53.47 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  51.87 
 
 		 349 aa  368  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  53.91 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  52.62 
 
 		 350 aa  364  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.59 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.52 
 
 		 355 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.92 
 
 		 350 aa  361  1e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.18 
 
 		 350 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.43 
 
 		 349 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  49.26 
 
 		 347 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  51.45 
 
 		 349 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.02 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.59 
 
 		 347 aa  351  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.6 
 
 		 350 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.29 
 
 		 349 aa  342  5.999999999999999e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  48.18 
 
 		 338 aa  341  9e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.05 
 
 		 358 aa  337  2.9999999999999997e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  49.24 
 
 		 345 aa  328  8e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  49.56 
 
 		 348 aa  325  6e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  50.77 
 
 		 342 aa  322  8e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.97 
 
 		 349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  47.4 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50 
 
 		 343 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.63 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.49 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  48.48 
 
 		 340 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.37 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  46.5 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.2 
 
 		 343 aa  291  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  46.51 
 
 		 343 aa  285  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  41.07 
 
 		 342 aa  240  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  39.88 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  37.82 
 
 		 350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  38.94 
 
 		 348 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  37.68 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.69 
 
 		 334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  35.99 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  37.69 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.09 
 
 		 335 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.75 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.76 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  35.86 
 
 		 349 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  35.78 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  39.44 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  35.67 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36 
 
 		 749 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  36.15 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.89 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  35.15 
 
 		 341 aa  203  3e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  34.35 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35.78 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.76 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  35.37 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  37.07 
 
 		 337 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.29 
 
 		 350 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.83 
 
 		 358 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  34.29 
 
 		 342 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.02 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.56 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.56 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0305  N-acetylneuraminic acid synthase domain-containing protein  36.16 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.351224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.88 
 
 		 338 aa  192  8e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.53 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.84 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  32.54 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  34.15 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.86 
 
 		 349 aa  189  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  34.43 
 
 		 346 aa  188  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  36.21 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.84 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.59 
 
 		 350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  35.31 
 
 		 332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  33.62 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  47.46 
 
 		 194 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01101  sialic acid synthase  33.04 
 
 		 335 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  34.14 
 
 		 341 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  35.51 
 
 		 360 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  33.81 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  33.81 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  32.76 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.52 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  31.64 
 
 		 344 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.33 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  32.93 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.04 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  37.13 
 
 		 289 aa  169  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>