183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1140 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1140  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 314 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2951  lysophospholipase  83.44 
 
 		 344 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1374  putative lysophospholipase L2, (lecithinase B)  77.39 
 
 		 315 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397005  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0871  alpha/beta hydrolase fold  78.03 
 
 		 314 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4534  alpha/beta hydrolase fold  78.03 
 
 		 314 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0764  alpha/beta hydrolase fold  79.62 
 
 		 315 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0956  alpha/beta hydrolase fold  76.75 
 
 		 314 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2819  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 		 315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0540505  normal  0.169347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5017  alpha/beta hydrolase fold protein  46.96 
 
 		 330 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.122553  normal  0.0843943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4557  alpha/beta hydrolase fold  46.65 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0125982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3878  alpha/beta hydrolase fold protein  44.59 
 
 		 345 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31752 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3641  lysophospholipase  43.71 
 
 		 333 aa  258  8e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5072  alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 		 329 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1727  alpha/beta hydrolase fold protein  47.12 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0411  alpha/beta hydrolase fold  47.76 
 
 		 333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.026116 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2747  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 323 aa  231  8.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.11769  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0046  lysophospholipase L2, putative  43.73 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0044  putative lysophospholipase L2  43.73 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1114  alpha/beta hydrolase fold  44.3 
 
 		 347 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4281  lysophospholipase  41.16 
 
 		 330 aa  223  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1981  alpha/beta hydrolase fold  41.47 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3322  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3740  lysophospholipase  40.81 
 
 		 332 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.594037  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3621  Lysophospholipase  41.8 
 
 		 324 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2716  alpha/beta hydrolase fold  38.19 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1219  alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.903294  normal  0.362699 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1563  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.202721  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1082  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2418  putative esterase/lipase/thioesterase  36.96 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.473748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4733  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0570  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0339831  hitchhiker  0.00000518617 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4006  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3914  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4119  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0780  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399291  normal  0.0368265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0083  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.902685  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4299  alpha/beta hydrolase fold protein  33.92 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000200396 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0044  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4354  alpha/beta hydrolase fold  33.92 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0245  lysophospholipase L2  33.92 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4496  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494887 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3314  alpha/beta hydrolase  30.61 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0011221  normal  0.0691996 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1831  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3916  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3961  lysophospholipase L2  33.66 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0496396  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0196  lysophospholipase L2  33.1 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00636994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4151  lysophospholipase L2  33.78 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000408546  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0196  lysophospholipase L2  32.11 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.951636  normal  0.0550864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0051  lysophospholipase  30.34 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.18197 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0094  alpha/beta hydrolase fold  30.54 
 
 		 324 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00537  lysophospholipase L2  30.28 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0039  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.302219  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002122  lysophospholipase L2  33.44 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4384  lysophospholipase L2  27.93 
 
 		 334 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3723  alpha/beta hydrolase fold  32.43 
 
 		 329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.211444 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00300  lysophospholipase  31.89 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1204  putative phospholipase  28.88 
 
 		 638 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2385  lysophospholipase L2  31.97 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1082  lysophospholipase L2  31.19 
 
 		 330 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3290  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.255418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0088  lysophospholipase  29.97 
 
 		 330 aa  112  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0146319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0221  lysophospholipase L2  29.77 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03704  lysophospholipase L(2)  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4154  Lysophospholipase  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3995  lysophospholipase L2  29.21 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.745904  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4292  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0558  lysophospholipase L2  29.21 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4183  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.251713 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4192  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03653  hypothetical protein  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4049  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4346  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5266  lysophospholipase L2  34.27 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.308584 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4169  lysophospholipase L2  31.45 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4348  lysophospholipase L2  31.45 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  0.869466 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4288  lysophospholipase L2  31.45 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.605073  normal  0.224615 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4190  lysophospholipase L2  31.45 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3971  lysophospholipase L2  33.68 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.461737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4241  lysophospholipase L2  31.45 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194167  normal  0.797648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0989  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0786107  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2931  lysophospholipase L2 LypA  26.89 
 
 		 322 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1188  putative lysophospholipase  25.68 
 
 		 329 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.273666  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0775  lysophospholipase L2  28.3 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.145213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2752  lysophospholipase L2, putative  28 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319017  hitchhiker  0.00474393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  31.33 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2772  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000235341  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3572  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.13 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0871  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3346  putative lysophospholipase protein  26.73 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.413653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2989  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.960197  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2799  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.61266  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1649  alpha/beta fold family hydrolase  33.57 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4455  Alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3541  alpha/beta hydrolase fold  23.9 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0994  putative hydrolase  31.65 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3215  alpha/beta hydrolase fold protein  24.08 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0934  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>