294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1120 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1120  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4290  ybaK/ebsC protein  75.8 
 
 		 157 aa  245  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.780598 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4093  hypothetical protein  83.44 
 
 		 157 aa  243  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.889047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3507  ybaK/ebsC protein  78.34 
 
 		 157 aa  241  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4554  ybaK/ebsC protein  76.43 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1328  hypothetical protein  72.61 
 
 		 158 aa  223  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0917031  normal  0.183333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3668  hypothetical protein  70.06 
 
 		 157 aa  220  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4777  ybaK/ebsC protein  73.89 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2421  ybaK/ebsC protein  68.15 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332084 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0153  ybaK/ebsC protein  73.24 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.548766  normal  0.0477422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2425  ybaK/ebsC protein  73.05 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0136  hypothetical protein  71.13 
 
 		 157 aa  214  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1012  ybaK/ebsC protein  70.67 
 
 		 157 aa  214  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3462  ybaK/ebsC protein  65.61 
 
 		 157 aa  200  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2876  ybaK/ebsC protein  64.05 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.10674 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4083  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  63.46 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0122906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04560  YbaK/ebsC protein  62.59 
 
 		 157 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.647549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1391  ybaK/ebsC protein  69.59 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167107  normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3407  ybaK/ebsC protein  64.96 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10900  ybaK/ebsC protein  50.71 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.882195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6293  ybaK/ebsC protein  49.67 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5733  ybaK/ebsC protein  46.04 
 
 		 165 aa  126  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1105  ybaK/ebsC protein  43.36 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1696  ybaK/ebsC protein  42.47 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0180556 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0012  ybaK/ebsC protein  44.59 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0187594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1664  ybaK/ebsC protein  48.59 
 
 		 170 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.773078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2376  ybaK/ebsC protein  50.71 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3047  ybaK/ebsC protein  51.8 
 
 		 163 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2906  YbaK/EbsC protein  43.05 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1201  ybaK/ebsC protein  43.92 
 
 		 155 aa  116  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00297582  hitchhiker  0.00069795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3090  ybaK/ebsC protein  41.96 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00342065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30720  ybaK/ebsC protein  47.06 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2899  ybaK/ebsC protein  49.64 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000923134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2730  YbaK/EbsC protein  46.97 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3222  hypothetical protein  43.62 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2065  ybaK/ebsC protein  43.51 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1093  hypothetical protein  42.95 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0414  hypothetical protein  41.73 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0228  hypothetical protein  40.26 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.822642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0113  ybaK/ebsC protein  41.5 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1431  ybaK/ebsC protein  43.07 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3195  ybaK/ebsC protein  42.95 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.827708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1181  ybaK/ebsC protein  44.06 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0675087  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3903  hypothetical protein  42.75 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0525  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1148  hypothetical protein  43.66 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0654966  hitchhiker  0.000000339512 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0470  YbaK/ebsC protein  37.27 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0602  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000350431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0543  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.243871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0576  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated region  42.75 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128455  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3039  hypothetical protein  40.13 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0541  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0558  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.743946  normal  0.562407 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0548  hypothetical protein  40.94 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0135035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0573  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0416  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2754  ybaK/ebsC protein  42.45 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00432  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.362307  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3129  ybaK/ebsC protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.393401  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2244  ybaK/ebsC protein  42.45 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3844  ybaK/ebsC protein  41.13 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0558  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00437  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.34185  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0146  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0520  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3135  hypothetical protein  40.27 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215151  unclonable  0.0000000116633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4234  ybaK/ebsC protein  41.13 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253359  normal  0.089415 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0135  hypothetical protein  39.86 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4191  ybaK/ebsC protein  48.41 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0625449  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2545  hypothetical protein  39.13 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0518  hypothetical protein  42.03 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0591601  normal  0.512075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4530  hypothetical protein  42.03 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.666338  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2416  ybaK/ebsC protein  39.19 
 
 		 163 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0960  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0092  ybaK/ebsC protein  41.45 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2822  ybaK/ebsC protein  38.51 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14060  ybaK/ebsC protein  40.76 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00161017  normal  0.469226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01257  hypothetical protein  40.91 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4166  ybaK/ebsC protein  43.8 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1106  ybaK/ebsC protein  42.65 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0785  ybaK/ebsC protein  38.1 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0016  ybaK/ebsC protein  42.45 
 
 		 154 aa  100  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0587946  normal  0.636311 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1750  hypothetical protein  42.96 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0053342  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4790  ybaK/ebsC protein  38.71 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170167  normal  0.9261 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1602  ybaK/ebsC protein  40.91 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.378112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3210  ybaK/ebsC protein  39.46 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3167  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.583041  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3248  ybaK/ebsC protein  39.73 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0893105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3147  ybaK/ebsC protein  39.73 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.317224  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1850  ybaK/ebsC protein  39.86 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3029  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.480981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1077  ybaK/ebsC protein  41.91 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4335  ybaK/ebsC protein  41.91 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.319378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1263  hypothetical protein  42.03 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0125501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14010  hypothetical protein  42.65 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3500  ybaK/ebsC protein  42.03 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00301765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0861  ybaK/ebsC protein  40.29 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.935106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1118  ybaK/ebsC protein  41.91 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.081988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3049  hypothetical protein  39.73 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17990  hypothetical protein  42.65 
 
 		 156 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>