More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1092 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4203  lytic murein transglycosylase  78.43 
 
 		 458 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4055  lytic murein transglycosylase  80.24 
 
 		 462 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15879  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1092  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 434 aa  887    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4881  lytic murein transglycosylase  79.06 
 
 		 442 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1375  lytic murein transglycosylase  76.9 
 
 		 412 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.399813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2243  hypothetical protein  75.97 
 
 		 412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2026  lytic murein transglycosylase  49.75 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1404  putative peptidoglycan-binding protein  46.92 
 
 		 372 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.671416  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1725  lytic murein transglycosylase  46.67 
 
 		 412 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2113  lytic murein transglycosylase  45.91 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.29233 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2920  lytic murein transglycosylase  44.01 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495206  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0164  lytic murein transglycosylase  45.26 
 
 		 389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2876  lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 		 405 aa  299  8e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2616  lytic murein transglycosylase  45.16 
 
 		 405 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0371  lytic murein transglycosylase  42.89 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2586  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000443653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  41.1 
 
 		 438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1994  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.53 
 
 		 433 aa  269  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2459  lytic murein transglycosylase  37 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  40.58 
 
 		 438 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2316  lytic murein transglycosylase  36.44 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000238033  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2269  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00964574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  40.58 
 
 		 438 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1755  lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 436 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000443123  hitchhiker  0.00243223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2341  lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 		 424 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000746143  normal  0.0730107 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2591  lytic murein transglycosylase  37.83 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000114496  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2630  lytic murein transglycosylase  37.73 
 
 		 438 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000526618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2705  lytic murein transglycosylase  37.83 
 
 		 438 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000884934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  38.82 
 
 		 438 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  36.41 
 
 		 409 aa  263  4.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  40.11 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  39.05 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  35.75 
 
 		 396 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  35.11 
 
 		 421 aa  259  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  36.47 
 
 		 440 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  38.54 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  38.32 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  36.77 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2029  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  37.29 
 
 		 401 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000748498  normal  0.890774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  35.32 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  39.69 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  39.74 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3432  lytic murein transglycosylase  37.13 
 
 		 428 aa  253  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.3 
 
 		 454 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  39.69 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  36.52 
 
 		 415 aa  250  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  35.79 
 
 		 377 aa  249  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  36.9 
 
 		 438 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  39.68 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1947  lytic murein transglycosylase  36.71 
 
 		 395 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000327314  normal  0.0135301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  39.73 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  38.03 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3366  lytic murein transglycosylase  47.55 
 
 		 283 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.332711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  38.05 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  35.81 
 
 		 417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  36.53 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  39.01 
 
 		 398 aa  240  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  34.66 
 
 		 410 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  41.27 
 
 		 393 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  39.14 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4395  putative transglycolase  47.24 
 
 		 271 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0443848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  38.84 
 
 		 398 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  34.08 
 
 		 395 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  38.25 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  37.35 
 
 		 398 aa  236  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  36.75 
 
 		 404 aa  236  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  38.36 
 
 		 421 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  37.2 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  40.51 
 
 		 400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  36.13 
 
 		 398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  36.97 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  38.61 
 
 		 466 aa  233  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  35.86 
 
 		 398 aa  232  9e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  35.9 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2141  lytic murein transglycosylase  33.67 
 
 		 437 aa  227  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000451146  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  35.9 
 
 		 413 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  34.74 
 
 		 474 aa  226  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  36.69 
 
 		 418 aa  226  9e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  37.08 
 
 		 720 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  36.8 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  39.9 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  36.51 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  37.34 
 
 		 419 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  35 
 
 		 432 aa  223  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  34.75 
 
 		 443 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 405 aa  220  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  34.75 
 
 		 451 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  36.54 
 
 		 486 aa  220  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  33.95 
 
 		 491 aa  219  8.999999999999998e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  33.87 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  32.75 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  34.67 
 
 		 481 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  32.43 
 
 		 490 aa  216  8e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  37.93 
 
 		 470 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  34.46 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3436  lytic murein transglycosylase  35.14 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>