More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1055 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1055  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 307 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0151578  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0539  glycosyl transferase family protein  83.71 
 
 		 307 aa  567  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  35.41 
 
 		 708 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 		 455 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.3 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 983 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  23.57 
 
 		 364 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  29.44 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.44 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  33.85 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  29.7 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.89 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 250 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  21.74 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.16 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  26.75 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  27.39 
 
 		 1035 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0211  glycosyltransferase  29.39 
 
 		 321 aa  72.4  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.97 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  37.74 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2506  b-glycosyltransferase  28.57 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.29 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.01 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0478  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0044  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0042  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4932  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5016  glycosyl transferase family 2  22.35 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.623026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  29.37 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  23.82 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  22.93 
 
 		 1264 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1182  glycosyl transferase family 2  24.63 
 
 		 269 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0499207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  25.72 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1383  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2081  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.15987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  28.16 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.11 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.11 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2048  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 1116 aa  67  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 		 581 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.71 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  33.01 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1951  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.435359 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.29 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 672 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2252  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.63 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  23.01 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 280 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 1239 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  35.79 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  22.89 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  36.08 
 
 		 729 aa  64.7  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>