213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1029 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1029  CHAD  100 
 
 
504 aa  1026    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  37.55 
 
 
596 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  32.48 
 
 
508 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  32.48 
 
 
508 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  30.75 
 
 
508 aa  202  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  33.2 
 
 
510 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  33.48 
 
 
511 aa  189  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  30.8 
 
 
519 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  29.88 
 
 
494 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  32.72 
 
 
512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  32.97 
 
 
512 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  33.56 
 
 
512 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  31.47 
 
 
514 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  30 
 
 
513 aa  160  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  29.96 
 
 
487 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0670  CHAD domain containing protein  33.11 
 
 
292 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.159134  hitchhiker  0.00700724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  30.68 
 
 
490 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  27.99 
 
 
543 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  30.75 
 
 
511 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  29.17 
 
 
510 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  29.38 
 
 
505 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  29.25 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.8 
 
 
318 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  30.63 
 
 
508 aa  124  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  27 
 
 
499 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  25.6 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  30.02 
 
 
540 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  27.2 
 
 
494 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  29.29 
 
 
539 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  29.9 
 
 
509 aa  103  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  28.83 
 
 
512 aa  99  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  24.86 
 
 
519 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  25.89 
 
 
510 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  28.73 
 
 
498 aa  96.7  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  26.24 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  26.11 
 
 
505 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  26.24 
 
 
489 aa  95.9  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4889  CHAD domain-containing protein  34.63 
 
 
588 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.1261  hitchhiker  0.000845101 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  25.67 
 
 
505 aa  91.3  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  28.32 
 
 
518 aa  87.4  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  25.26 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2705  CHAD domain-containing protein  28.94 
 
 
492 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.07 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  31.25 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  25.36 
 
 
502 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  28.97 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3671  CHAD domain-containing protein  32.49 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4508  CHAD domain-containing protein  32.49 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3856  CHAD domain-containing protein  32.49 
 
 
540 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.284163  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  30.08 
 
 
545 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  24.23 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  25.71 
 
 
545 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  26.88 
 
 
498 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  26.84 
 
 
511 aa  81.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  26.74 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  27.44 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  26.74 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  31.15 
 
 
321 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  26.74 
 
 
508 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  31.03 
 
 
577 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  28.88 
 
 
329 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  29.03 
 
 
454 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  28.28 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  30.28 
 
 
310 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1189  hypothetical protein  32.16 
 
 
347 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1092  CHAD domain containing protein  26.11 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  30.77 
 
 
503 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  30.1 
 
 
495 aa  73.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1861  adenylate cyclase  23.61 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0847952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  29.41 
 
 
503 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  29.69 
 
 
688 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0872  CHAD domain-contain protein  29.69 
 
 
691 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  29.69 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  29.69 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2063  CHAD domain-containing protein  27.43 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.599842  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2434  CHAD domain-containing protein  29.69 
 
 
649 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  29.69 
 
 
640 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  27 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  27 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  31.58 
 
 
503 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  30.36 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6577  CHAD domain-containing protein  28.42 
 
 
512 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.483956  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0409  hypothetical protein  27 
 
 
292 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.266206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  30.36 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  29.41 
 
 
503 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  30.36 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  32.16 
 
 
508 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3406  adenylate cyclase  28.65 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0100742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0294  hypothetical protein  30.85 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.513633  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0643  adenylate cyclase  30.85 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000496998  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1884  CHAD domain-containing protein  26.5 
 
 
505 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1341  CHAD domain-containing protein  26.98 
 
 
523 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  30.36 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0562  adenylate cyclase  30.85 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000134146  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  26.5 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  26.5 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  26 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  26.5 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  29.76 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  26.5 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>