More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0998 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0998  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.333129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0688  two component transcriptional regulator  66.67 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  62.9 
 
 		 221 aa  291  7e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  62.56 
 
 		 221 aa  285  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3404  response regulator transcription regulator protein  66.36 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.91 
 
 		 221 aa  279  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.45 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  59.36 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.36 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  59.09 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  60.73 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 		 220 aa  262  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 220 aa  261  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5019  two component transcriptional regulator  63.18 
 
 		 221 aa  260  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14757  normal  0.102893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  58.18 
 
 		 220 aa  257  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 225 aa  245  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.88 
 
 		 219 aa  244  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 220 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  58.8 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  58.33 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  58.33 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  58.33 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  58.33 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  58.33 
 
 		 220 aa  240  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2598  two component transcriptional regulator  56.11 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458585  normal  0.0460703 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4098  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.96 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  57.94 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  57.94 
 
 		 283 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.7 
 
 		 227 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3293  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  53.07 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  49.78 
 
 		 246 aa  231  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.8 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  52.02 
 
 		 242 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 279 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 		 244 aa  228  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  57.28 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  48.2 
 
 		 232 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3110  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.178244 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  48.2 
 
 		 223 aa  224  8e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  49.77 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  50.23 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  53.7 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  48.39 
 
 		 220 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.32 
 
 		 219 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.17 
 
 		 218 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  48.39 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  52.29 
 
 		 219 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  47.47 
 
 		 220 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  52.31 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  211  9e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  52.31 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 219 aa  209  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  48.17 
 
 		 222 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5363  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00637832  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4924  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000483234  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3443  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0448196  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3965  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.702893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  53.7 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 220 aa  206  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3691  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000843383  normal  0.576087 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  48.89 
 
 		 235 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  204  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  49.31 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.08 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  46.36 
 
 		 221 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2328  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1597  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  46.36 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  47.83 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  47.83 
 
 		 225 aa  198  3.9999999999999996e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.77 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  46.58 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.52 
 
 		 223 aa  196  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 221 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  45.66 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2786  response regulator  42.68 
 
 		 243 aa  193  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  45.87 
 
 		 227 aa  191  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  46.26 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  43.12 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>