62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0995 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  61.16 
 
 		 802 aa  992    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  61.16 
 
 		 803 aa  983    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 800 aa  1621    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  57.18 
 
 		 801 aa  893    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.16 
 
 		 786 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  44.16 
 
 		 786 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  43.03 
 
 		 835 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.83 
 
 		 814 aa  568  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.74 
 
 		 761 aa  559  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.66 
 
 		 692 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.66 
 
 		 681 aa  504  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  42.07 
 
 		 798 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.68 
 
 		 715 aa  438  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  35.23 
 
 		 881 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.75 
 
 		 882 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  34.62 
 
 		 882 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  34.75 
 
 		 881 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  36.03 
 
 		 1160 aa  364  4e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.06 
 
 		 808 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.06 
 
 		 808 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.31 
 
 		 838 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.52 
 
 		 860 aa  339  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.31 
 
 		 837 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.49 
 
 		 820 aa  331  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.78 
 
 		 841 aa  326  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.31 
 
 		 838 aa  325  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  31.38 
 
 		 847 aa  324  5e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.79 
 
 		 858 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.79 
 
 		 858 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.16 
 
 		 858 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.58 
 
 		 840 aa  317  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.98 
 
 		 833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.34 
 
 		 821 aa  311  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.32 
 
 		 817 aa  297  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.94 
 
 		 803 aa  296  9e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.5 
 
 		 777 aa  281  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.13 
 
 		 1505 aa  257  7e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  29.14 
 
 		 1592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.58 
 
 		 1132 aa  251  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.64 
 
 		 433 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.49 
 
 		 430 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.22 
 
 		 644 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  22.04 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  24.56 
 
 		 644 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  45.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  45.57 
 
 		 180 aa  69.7  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.81 
 
 		 627 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.58 
 
 		 621 aa  68.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  22.97 
 
 		 621 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  23.51 
 
 		 621 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  22.98 
 
 		 668 aa  65.9  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  24 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.47 
 
 		 647 aa  63.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.83 
 
 		 621 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  28.06 
 
 		 647 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.52 
 
 		 604 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.13 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  22.2 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  23.53 
 
 		 610 aa  51.6  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  30.92 
 
 		 484 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  31.25 
 
 		 650 aa  47.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  28 
 
 		 380 aa  44.3  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>