More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0972 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 762 aa  1536    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  80.37 
 
 		 777 aa  1157    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  68.9 
 
 		 749 aa  942    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2620  TonB-dependent siderophore receptor  46.45 
 
 		 770 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  49.78 
 
 		 839 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  49.78 
 
 		 851 aa  598  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  49.21 
 
 		 879 aa  598  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  46.67 
 
 		 773 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  46.03 
 
 		 773 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  40.98 
 
 		 768 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  44.13 
 
 		 744 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  41.58 
 
 		 746 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  42.51 
 
 		 764 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  41.95 
 
 		 801 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  43.85 
 
 		 754 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  43.01 
 
 		 808 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  42.25 
 
 		 800 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  41.72 
 
 		 801 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  43.28 
 
 		 700 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  40.42 
 
 		 802 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  40.94 
 
 		 753 aa  486  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  43.54 
 
 		 764 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  41.84 
 
 		 771 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  42.75 
 
 		 709 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  41.07 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  42.4 
 
 		 823 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  41.46 
 
 		 734 aa  469  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  41.22 
 
 		 761 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  40.98 
 
 		 756 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  40.09 
 
 		 804 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  39.22 
 
 		 805 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  39.21 
 
 		 804 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  37.09 
 
 		 746 aa  448  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  39.01 
 
 		 742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  39.36 
 
 		 819 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  39.06 
 
 		 809 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  39.26 
 
 		 804 aa  442  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 728 aa  438  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 728 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  39.04 
 
 		 725 aa  436  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  39.91 
 
 		 712 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  38.92 
 
 		 761 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  39.34 
 
 		 729 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 		 755 aa  428  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  39.85 
 
 		 722 aa  428  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  38.68 
 
 		 726 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 731 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 772 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  37.79 
 
 		 772 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  36.2 
 
 		 730 aa  418  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1656  ferrichrome receptor FcuA  37.98 
 
 		 720 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000210688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  37.74 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2373  ferrichrome receptor FcuA  38.46 
 
 		 763 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000216306  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2469  TonB-dependent siderophore receptor  38.46 
 
 		 768 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000279609  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  36.56 
 
 		 729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  37.17 
 
 		 730 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  37.59 
 
 		 729 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  37.84 
 
 		 737 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  38.33 
 
 		 758 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  37.99 
 
 		 753 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  37.15 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 724 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  36.03 
 
 		 759 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1058  TonB-dependent siderophore receptor  33.8 
 
 		 728 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0962342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  31.2 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 751 aa  242  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 728 aa  242  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  31.24 
 
 		 743 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 743 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  30.06 
 
 		 743 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 		 698 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 811 aa  210  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 		 710 aa  208  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  27.74 
 
 		 708 aa  208  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  28.4 
 
 		 724 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.33 
 
 		 710 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 729 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 710 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.89 
 
 		 705 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 724 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.62 
 
 		 811 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 702 aa  192  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.04 
 
 		 716 aa  191  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 728 aa  191  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 726 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 742 aa  189  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 712 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 719 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  28.31 
 
 		 727 aa  184  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.87 
 
 		 727 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.71 
 
 		 704 aa  181  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  27.9 
 
 		 729 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 685 aa  179  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 774 aa  179  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.97 
 
 		 702 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 727 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 715 aa  172  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 718 aa  168  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>