More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0865 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  100 
 
 
404 aa  820    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  63.85 
 
 
391 aa  501  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  56.35 
 
 
405 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  53.13 
 
 
408 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  55.89 
 
 
400 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  53.67 
 
 
407 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  51.03 
 
 
403 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  56.14 
 
 
400 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  53.73 
 
 
405 aa  396  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  53.15 
 
 
405 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  55.13 
 
 
389 aa  392  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  53.69 
 
 
397 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  52.13 
 
 
394 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  51.26 
 
 
396 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  52.82 
 
 
394 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  53.28 
 
 
401 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  52.41 
 
 
398 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  52.04 
 
 
393 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  52.82 
 
 
393 aa  384  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  49.87 
 
 
404 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  49.36 
 
 
402 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  50.38 
 
 
1305 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  52.15 
 
 
398 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  50.9 
 
 
392 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  50.37 
 
 
411 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  50.51 
 
 
392 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  47.98 
 
 
396 aa  366  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  51.12 
 
 
400 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  49.1 
 
 
390 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  50.38 
 
 
399 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  49.36 
 
 
400 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  50.38 
 
 
1230 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  51.95 
 
 
389 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  50 
 
 
390 aa  353  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  51.16 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  49.11 
 
 
402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  48.98 
 
 
402 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  52.03 
 
 
389 aa  349  4e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  51.01 
 
 
1230 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  48.74 
 
 
398 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  47.46 
 
 
403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  49.49 
 
 
400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  49.88 
 
 
1228 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  48.19 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  50.13 
 
 
394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  47.22 
 
 
402 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  45.88 
 
 
393 aa  332  6e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  47.69 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  48.15 
 
 
396 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  48.15 
 
 
396 aa  324  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  47.22 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  47.22 
 
 
402 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  48.41 
 
 
396 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  43.48 
 
 
391 aa  319  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  45.09 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  45.09 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  45.57 
 
 
395 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  46.58 
 
 
385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  45.26 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  42.6 
 
 
372 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  42.42 
 
 
397 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  46.45 
 
 
404 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  44.79 
 
 
371 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  42.49 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  42.09 
 
 
408 aa  301  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  44.22 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  44.22 
 
 
392 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  43.96 
 
 
392 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  41.65 
 
 
372 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  43.69 
 
 
397 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  43.96 
 
 
392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  43.96 
 
 
392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  43.96 
 
 
392 aa  297  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  44.61 
 
 
412 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  45.15 
 
 
392 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  45.09 
 
 
410 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  42.86 
 
 
407 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  43.86 
 
 
391 aa  292  7e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  43.83 
 
 
402 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  43.85 
 
 
392 aa  292  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  42 
 
 
401 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  42.93 
 
 
393 aa  289  7e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  42.75 
 
 
401 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  43.4 
 
 
416 aa  288  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  45.85 
 
 
399 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  44.72 
 
 
399 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40.66 
 
 
394 aa  285  9e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  39.9 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  39.7 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  40.4 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  40.4 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  42.56 
 
 
399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  40.59 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  40.49 
 
 
403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  39.85 
 
 
406 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  43.56 
 
 
413 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  40.45 
 
 
398 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  42 
 
 
392 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  40.54 
 
 
398 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  40.94 
 
 
398 aa  280  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>