118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0738 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0738  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.607595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1281  putative general secretion pathway protein H, GspH  54.67 
 
 		 154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3006  putative general secretion pathway protein H precursor  59.42 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0913  general secretion pathway protein H  54.11 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.519462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2614  putative general secretion pathway protein H  57.14 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2110  putative general secretion pathway protein H precursor  54 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0128014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1583  putative general secretion pathway protein H precursor  31.03 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0931291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2892  general secretion pathway protein H  29.41 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.229929  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0859  general secretory pathway protein H precursor  27.86 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552606  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0772  general secretion pathway protein H  27.86 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.695351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1784  hypothetical protein  36.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  27.97 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1117  general secretion pathway protein H  28.24 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  27.86 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2391  general secretion pathway protein G  28.24 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000271033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  27.01 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  27.34 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  45.45 
 
 		 174 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  26.72 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001889  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  30.51 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3314  general secretion pathway protein H  26.62 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1073  general secretion pathway protein G  25.34 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.56277  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  35.29 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1524  putative pseudopilin H precursor  25.52 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.504554  normal  0.285014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  36.51 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  38.98 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  45.45 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0134  hypothetical protein  32.5 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00604  general secretion pathway protein G  25.76 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  40.43 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1302  general secretion pathway protein H  25.69 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0144  general secretion pathway protein G  27.92 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  36.11 
 
 		 168 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  48.72 
 
 		 162 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  40 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  37.35 
 
 		 179 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.22 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  50 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3148  general secretion pathway protein H  26.71 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.367938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  41.86 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  25.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  25.76 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  34.92 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4177  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 144 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  47.5 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  40.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3007  general secretion pathway protein G  26.83 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.303532 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  37.88 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  52.78 
 
 		 196 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  24.8 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  53.85 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  53.85 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  37.88 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1049  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  34.85 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  34.48 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4157  general secretion pathway protein H  26.06 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000758704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  46.51 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  42.22 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  27.61 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1011  hypothetical protein  32.61 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.60577e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  30.59 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0739  general secretion pathway protein G  24.81 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  50 
 
 		 148 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0898  hypothetical protein  34.44 
 
 		 115 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.725433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  27.43 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  27.2 
 
 		 150 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  26.52 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1302  general secretion pathway protein G  27.2 
 
 		 153 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  30.47 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  30.47 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  26.52 
 
 		 136 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  32.69 
 
 		 147 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  45.65 
 
 		 162 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  31.58 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  26.52 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  35.29 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  51.43 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  42.86 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1090  general secretion pathway protein G  29.69 
 
 		 144 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319049  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  34.04 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_142  general secretion pathway protein H  26.92 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0754  type II secretory pathway, pseudopilin PulG  53.57 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.430859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3420  general secretion pathway protein H  34.38 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465918 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>