More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0631 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  85.1 
 
 		 463 aa  800    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  71.77 
 
 		 464 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  100 
 
 		 463 aa  926    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  66.59 
 
 		 464 aa  630  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  65.95 
 
 		 464 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  67.46 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  65.3 
 
 		 464 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  42.45 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  40.97 
 
 		 729 aa  236  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  35.29 
 
 		 707 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1480  OmpA/MotB domain protein  32.6 
 
 		 612 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0701  hypothetical protein  31.05 
 
 		 630 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127075  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  35.68 
 
 		 320 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  33.59 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  35.06 
 
 		 316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  32.82 
 
 		 316 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  33.2 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  34.2 
 
 		 311 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  32.43 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  32.43 
 
 		 247 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2669  OmpA/MotB domain-containing protein  29.77 
 
 		 652 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.650206 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  33.61 
 
 		 277 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1009  OmpA family outer membrane protein  29.59 
 
 		 652 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  33.77 
 
 		 310 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.33 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 		 768 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  33.77 
 
 		 310 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0218  OmpA/MotB domain-containing protein  29.82 
 
 		 642 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3590  OmpA/MotB  45.3 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1877  OmpA/MotB  44.44 
 
 		 434 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0777893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1976  OmpA/MotB domain protein  47.86 
 
 		 441 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0260904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  31.14 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  31.2 
 
 		 268 aa  108  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  40.15 
 
 		 241 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  49.5 
 
 		 694 aa  104  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3101  OmpA domain protein  28.7 
 
 		 617 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.409183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  42.03 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  29.1 
 
 		 653 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3914  OmpA/MotB  29.05 
 
 		 658 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3511  hypothetical protein  32.04 
 
 		 668 aa  100  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.789255 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 218 aa  99  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  50.5 
 
 		 658 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3187  hypothetical protein  31.39 
 
 		 669 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.62 
 
 		 369 aa  98.2  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.15 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.15 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  40.58 
 
 		 362 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  40.78 
 
 		 230 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  44.34 
 
 		 640 aa  96.3  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 		 231 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  47.12 
 
 		 228 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  42.57 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  35.97 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 228 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  47.12 
 
 		 228 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  47.06 
 
 		 226 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.4 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 525 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  41.9 
 
 		 510 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  45.71 
 
 		 620 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  38.93 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  43.4 
 
 		 374 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 		 216 aa  93.2  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  42.34 
 
 		 679 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  41.28 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  42.59 
 
 		 537 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 		 193 aa  90.9  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  31.65 
 
 		 239 aa  90.9  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  38.12 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  45.37 
 
 		 334 aa  90.5  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  42.31 
 
 		 319 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009441  Fjoh_0258  OmpA/MotB domain-containing protein  40.74 
 
 		 231 aa  90.1  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.686752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.69 
 
 		 517 aa  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.28 
 
 		 543 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.56 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  46.53 
 
 		 402 aa  89.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 		 361 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.32 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  37.68 
 
 		 218 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  40 
 
 		 656 aa  89.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  44.23 
 
 		 638 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  41.12 
 
 		 641 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  37.01 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  34.54 
 
 		 533 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 		 306 aa  89  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  44.86 
 
 		 330 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3382  hypothetical protein  30.26 
 
 		 670 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  41.9 
 
 		 266 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  45.71 
 
 		 630 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  35.88 
 
 		 671 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 		 214 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  39.42 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.78 
 
 		 240 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0934  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 217 aa  87.8  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000729955  hitchhiker  0.000000173865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.37 
 
 		 544 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>