More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0482 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0482  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 150 aa  305  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0387  NUDIX hydrolase  93.02 
 
 		 129 aa  248  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.724674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0029  NUDIX hydrolase  82.09 
 
 		 137 aa  227  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  81.95 
 
 		 133 aa  223  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0597  NUDIX hydrolase  80.45 
 
 		 133 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  82.93 
 
 		 136 aa  214  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  79.55 
 
 		 133 aa  213  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  78.03 
 
 		 133 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2586  NUDIX hydrolase  76.52 
 
 		 138 aa  209  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  74.07 
 
 		 137 aa  202  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1733  mutator MutT protein  73.88 
 
 		 144 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  75.57 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  74.62 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  71.76 
 
 		 138 aa  199  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  71.32 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  71.32 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1166  NTP pyrophosphohydrolase  74.24 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2828  mutator MutT protein  74.24 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2758  NUDIX hydrolase  74.24 
 
 		 132 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  80.34 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  71.76 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3564  mutator MutT protein  72.73 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3658  mutator MutT protein  79.17 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236932  normal  0.362443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  70.77 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0292  mutator mutT protein  74.22 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  74.42 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2596  mutator MutT protein  71.21 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.202287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0393  NUDIX hydrolase  70 
 
 		 151 aa  190  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0143853  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2914  mutator mutT protein  70.99 
 
 		 136 aa  189  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.262626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  76.52 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  77.78 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  76.92 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  76.07 
 
 		 146 aa  181  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  63.31 
 
 		 347 aa  180  7e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1547  NUDIX hydrolase  63.08 
 
 		 334 aa  176  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2266  mutator MutT protein  57.69 
 
 		 138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.97404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0364  mutator mutT protein  61.16 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1792  NUDIX hydrolase  56.3 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  55.22 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1398  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  47.58 
 
 		 318 aa  106  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1907  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3582  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.54 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000334964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  44.92 
 
 		 302 aa  97.4  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0858  hypothetical protein  43.59 
 
 		 317 aa  97.1  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0428  NUDIX hydrolase  45.67 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.834318  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57190  hypothetical protein  44 
 
 		 315 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2414  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.88 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4971  hypothetical protein  43.2 
 
 		 315 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3770  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.16 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  44.8 
 
 		 313 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  40.94 
 
 		 329 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  40.8 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0027  hypothetical protein  44.83 
 
 		 312 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.132128 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0465  hypothetical protein  45.53 
 
 		 320 aa  92.8  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  37.3 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  42.28 
 
 		 317 aa  92.8  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0405  hypothetical protein  45.53 
 
 		 320 aa  91.7  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2179  hypothetical protein  42.5 
 
 		 314 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2479  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 135 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0787  NUDIX hydrolase  44.92 
 
 		 128 aa  90.5  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.585292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0419  mutator MutT protein  37.3 
 
 		 129 aa  90.5  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01728  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.10262  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1883  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01716  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.15744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  39.37 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0934  hypothetical protein  43.33 
 
 		 313 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.268176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2967  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668202  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1106  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000361121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1873  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.440168  hitchhiker  0.000083786 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1430  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.86 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.166534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0634  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4425  hypothetical protein  40 
 
 		 314 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0620  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  39.69 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00509721  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  37.4 
 
 		 363 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1983  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.11 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000136061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0363  mutator MutT protein  34.15 
 
 		 131 aa  88.2  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4397  mutT/nudix family protein  40.8 
 
 		 316 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  42.11 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  39.32 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  40.62 
 
 		 310 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2154  NUDIX hydrolase  43.75 
 
 		 206 aa  87  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114898  hitchhiker  0.00867781 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  35.94 
 
 		 133 aa  87  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  40.71 
 
 		 306 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2045  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.86 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1428  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.86 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3115  NUDIX hydrolase  42.06 
 
 		 147 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.630714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  43.81 
 
 		 329 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1007  hypothetical protein  40.65 
 
 		 325 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  43.81 
 
 		 329 aa  85.5  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  38.17 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01721  adenine glycosylase  39.39 
 
 		 400 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  41.86 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>