49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0473 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 155 aa  316  6e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  73.55 
 
 		 155 aa  229  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  65.38 
 
 		 158 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  45.7 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  33.97 
 
 		 180 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  33.97 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  36.91 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  32.43 
 
 		 146 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  36.24 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  35.22 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  35.06 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  33.11 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  36.91 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  29.29 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  26.62 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  27.54 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  33.11 
 
 		 126 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  28.66 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  30.66 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  27.74 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  25.68 
 
 		 479 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  31.65 
 
 		 245 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  29.45 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  28.83 
 
 		 127 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  25.2 
 
 		 179 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  31.53 
 
 		 247 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  25.17 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  29.27 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  33.8 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  28.12 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  25.17 
 
 		 180 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  27.14 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  31.62 
 
 		 255 aa  43.9  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  31.25 
 
 		 443 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  26.87 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  25 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  22.63 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1366  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 211 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  24.29 
 
 		 176 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  24.43 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  29.05 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  27.85 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  38.89 
 
 		 575 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  37.25 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  29.37 
 
 		 371 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>