41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0468 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  477  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  82.5 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  65.61 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  69.63 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  61.85 
 
 		 272 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  69.9 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  72.29 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  70.24 
 
 		 345 aa  123  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  65.48 
 
 		 437 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  64.29 
 
 		 425 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  69.05 
 
 		 345 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  72.46 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  72.46 
 
 		 311 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  73.85 
 
 		 431 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  69.12 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  69.23 
 
 		 401 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  46.15 
 
 		 294 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  63.33 
 
 		 275 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  69.23 
 
 		 252 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  70.31 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  58.14 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  69.23 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  49.59 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  47.54 
 
 		 144 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  66.67 
 
 		 263 aa  95.9  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  51.92 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  56.1 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  56.45 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  59.65 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  48.72 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  54.41 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  45.45 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  54.41 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  47.62 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  57.14 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  47.3 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  43.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  38.4 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  44.83 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  40.91 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>