139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0467 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  90.65 
 
 		 246 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  80.08 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  73.17 
 
 		 254 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  71.14 
 
 		 254 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  73.75 
 
 		 257 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  73.33 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  59.49 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  53.85 
 
 		 250 aa  262  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  52.7 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  53.42 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  53.39 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  48.4 
 
 		 257 aa  248  9e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  47.7 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  51.34 
 
 		 244 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  50 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  46.5 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  46.5 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  46.12 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  46.53 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  45.71 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  44.81 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  44.86 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  47.14 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  46.25 
 
 		 277 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  46.26 
 
 		 256 aa  202  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  46.23 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  41.15 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  44.91 
 
 		 235 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  40.16 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  40.16 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  42.79 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  43.66 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  41.55 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  40.26 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  42.2 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  38.22 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 256 aa  138  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0954  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 260 aa  65.5  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2816  generic methyl-transferase  32.42 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1586  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.217774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  30 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  28.31 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1703  SAM-dependent methyltransferase  28.48 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.112357  normal  0.713631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2280  hypothetical protein  32.12 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  26.29 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1620  generic methyl-transferase  28.68 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.152762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  25.65 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  25.91 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 		 287 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29610  hypothetical protein  24.15 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4896  methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3468  hypothetical protein  24.18 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1971  hypothetical protein  36.9 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2652  methyltransferase type 11  47.46 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714866 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  26.54 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  26.54 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.95 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 238 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1463  hypothetical protein  40 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0975839  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 265 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1974  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1679  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 273 aa  49.7  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.822935 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2339  Methyltransferase type 11  43.94 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.560895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1744  methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 259 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 238 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  32.29 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1512  methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1762  hypothetical protein  24.71 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.479103  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2185  hypothetical protein  24.14 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  35.8 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  32.14 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  29.93 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0497  methyltransferase type 11  33.7 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00659645  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 272 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 237 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>